使用函数的字符名称和参数作为字符向量将函数应用于 data.table

Question

我想在 data.table 上通过字符名称调用函数。每个函数还有一个参数向量（因此有一长串函数可以应用于 data.table）。参数是 data.table 列。我的第一个想法是 do.call 将是完成该任务的好方法。这是一个简单的示例，其中一个函数名称为运行并且它是要传递的列向量：

# set up dummy data 
set.seed(1)
DT <- data.table(x = rep(c("a","b"),each=5), y = sample(10), z = sample(10))
# columns to use as function arguments
mycols <- c('y','z')
# function name 
func <- 'sum'
# my current solution:
DT[, do.call(func, list(get('y'), get('z'))), by = x]
#    x V1
# 1: a 47
# 2: b 63

我对此不满意，因为它需要具体命名每一列。我只想传递一个字符向量 mycols。

在这种情况下，我需要的其他解决方案是：

DT[, do.call(func, .SD), .SDcols = mycols, by = x]

但是自定义函数有点问题，唯一对我有用的解决方案是第一个：

#own dummy function    
myfunc <- function(arg1, arg2){
  arg1+arg2
}
func <- 'myfunc'
DT[, do.call(func, list(get('y'), get('z'))), by = x] 
#   x V1
#  1: a  6
#  2: a  6
#  3: a 11
#  4: a 17
#  5: a  7
#  6: b 15
#  7: b 17
#  8: b 10
#  9: b 11
# 10: b 10
# second solution does not work 
DT[, do.call(func, .SD), .SDcols = mycols, by = x]
# Error in myfunc(y = c(3L, 4L, 5L, 7L, 2L), z = c(3L, 2L, 6L, 10L, 5L)) : 
#  unused arguments (y = c(3, 4, 5, 7, 2), z = c(3, 2, 6, 10, 5))

据我了解，它假设 myfunc 有参数 y, z 这是不正确的。应该有变量 y,z 应该传递给参数 arg1, arg2.

我也试过 mget 函数，但也没有成功：

DT[, do.call(func, mget(mycols)), by = x] 
# Error: value for ‘y’ not found

我可能遗漏了一些相当明显的东西，在此先感谢您的指导。

Answer 1

这可能取决于您要使用的函数类型，但您似乎 Reduce 可能感兴趣。

这是你的两个例子：

mycols <- c('y','z')
func <- 'sum'

DT[, Reduce(func, mget(mycols)), by = x]
#    x V1
# 1: a 47
# 2: b 63

myfunc <- function(arg1, arg2){
  arg1+arg2
}
func <- 'myfunc'

DT[, Reduce(func, mget(mycols)), by = x]
#     x V1
#  1: a  6
#  2: a  6
#  3: a 11
#  4: a 17
#  5: a  7
#  6: b 15
#  7: b 17
#  8: b 10
#  9: b 11
# 10: b 10

Answer 2

这是一个帮助我实现我想要的解决方案。

func <- 'sum'
mycols <- c('y','z')
DT[, do.call(func, lapply(mycols, function(x) get(x))), by = x]
#    x V1
# 1: a 47
# 2: b 63

可以向其传递 base 函数或自定义函数（不像 Reduce 解决方案那么具体）。

Answer 3

是的，您遗漏了一些东西（好吧，它不是很明显，但仔细调试错误可以确定问题所在）。您的函数需要命名参数 arg1 和 arg2。您正在通过 do.call 向其传递参数 y = ... 和 z = ...（您已经注意到）。解决方案是传递没有名称的列表：

> DT[, do.call(func, unname(.SD[, mycols, with = F])), by = x]
    x V1
 1: a  6
 2: a  6
 3: a 11
 4: a 17
 5: a  7
 6: b 15
 7: b 17
 8: b 10
 9: b 11
10: b 10

使用函数的字符名称和参数作为字符向量将函数应用于 data.table

Apply function to data.table using function's character name and arguments as character vector

r

do.call

data.table