Weka:在没有 headers 的情况下加载 CSV 文件

Weka: loading CSV file without headers

如何在 Weka 中不使用 headers 加载 CSV 文件?

有一些相关的问题,但是none似乎进入了重点。

MWE

这是 test.csv 文件:

20,1,"+"
30,2,"+"
30,1,"+"
15,1,"-"
10,0,"-"

这里是 Test.java 代码:

// javac -Xlint -cp weka.jar Test.java && java -cp .:weka.jar Test

import weka.core.converters.CSVLoader;
import weka.core.Instances;
import weka.classifiers.Classifier;
import weka.classifiers.bayes.NaiveBayes;
import weka.classifiers.Evaluation;
import java.io.File;

class Test
{
    public static void main(String[] args) {
        try {
            CSVLoader loader = new CSVLoader();
            loader.setOptions(new String[] {"-H"});
            loader.setSource(new File("test.csv"));

            Instances tr = loader.getDataSet();
            tr.setClassIndex(tr.numAttributes() - 1);

            Classifier m = (Classifier) new NaiveBayes();
            m.buildClassifier(tr);

            Evaluation eval = new Evaluation(tr);
            eval.evaluateModel(m, tr);

            System.out.println(eval.toSummaryString());
        }
        catch(Exception ex) {
            System.out.println(ex);
        }
    }
}

当运行时,它只报告4个实例,而不是5个。如果我添加 headers,那么它可以正常工作。

Correctly Classified Instances           4              100      %
Incorrectly Classified Instances         0                0      %
Kappa statistic                          1     
Mean absolute error                      0.0065
Root mean squared error                  0.0112
Relative absolute error                  1.3088 %
Root relative squared error              2.2477 %
Total Number of Instances                4     

注意我用过:

            loader.setOptions(new String[] {"-H"});

直接APIloader.setNoHeaderRowPresent(true);我也试过,但是Weka 3.6.13好像没有。

参考文献:

编辑: 事实证明这是 3.6.13 中的问题。该代码适用于 3.7.10。

我不确定 3.6.13,但 3.7.10 的代码显示,如果设置了 setNoHeaderRowPresent,则会添加第一行数据 true

您正在设置 false,将其设置为来自 CSVLoader grepcode 的 true.Refrence

Set whether there is no header row in the data.
Parameters: b true if there is no header row in the data
public void setNoHeaderRowPresent(boolean b) {
m_noHeaderRow = b; 293
}

if (m_noHeaderRow) {    
  m_rowBuffer.add(firstRow);  
 }

所以在你的代码中使用

loader.setNoHeaderRowPresent(true)

而不是 loader.setNoHeaderRowPresent(false) 以包含数据集中的第一行。

作为解决方法,这会读取 CSV 文件并将其作为 ARFF 文件传递​​:

// javac -Xlint -cp weka.jar Test.java && java -cp .:weka.jar Test

import weka.core.converters.CSVLoader;
import weka.core.Instances;
import weka.classifiers.Classifier;
import weka.classifiers.bayes.NaiveBayes;
import weka.classifiers.Evaluation;
import java.io.FileReader;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.StringReader;
import java.lang.StringBuffer;

class Test
{
    public static void main(String[] args) {
        try {
            String filename = "test.csv";
            BufferedReader br = new BufferedReader(new FileReader(filename));
            String line = br.readLine();
            int cols = line.length() - line.replace(",", "").length() + 1;

            StringBuilder arff = new StringBuilder("@RELATION test\n");
            for(int i = 0; i < cols-1; i++) {
                arff.append("@ATTRIBUTE ");
                arff.append(String.valueOf((char)(i + 'a')));
                arff.append(" NUMERIC\n");
            }
            arff.append("@ATTRIBUTE class {+,-}\n");
            arff.append("@DATA\n");

            while(line != null) {
                arff.append(line);
                arff.append("\n");
                line = br.readLine();
            }

            System.out.println(arff.toString());
            Instances tr = new Instances(new StringReader(arff.toString()));

            tr.setClassIndex(tr.numAttributes() - 1);

            Classifier m = (Classifier) new NaiveBayes();
            m.buildClassifier(tr);

            Evaluation eval = new Evaluation(tr);
            eval.evaluateModel(m, tr);

            System.out.println(eval.toSummaryString());
        }
        catch(Exception ex) {
            System.out.println(ex);
        }
    }
}