如何将 RDKit 添加到 PyCharm 中的项目中？

Question

因此，我正在尝试将 RDKit 添加到我在 PyCharm 中的项目中。我发现如果你使用解释器 /usr/bin/python2.7 PyCharm 将尝试使用 pip 安装东西。而 RDKit 需要 conda。我试图将解释器更改为 conda，但 RDKit 不在列表中，或者它无法使用 repo 打开 URL。有谁知道如何解决这个问题？

顺便说一句，在安装东西的同时保留解释器 /usr/bin/python2.7 是否可以使其使用其他任何东西（而不是 pip）？

Answer 1

我终于找到了方法，一点也不难：

安装畅达；
按照these instructions
像这样转到 PyCharm 中的首选项：

或者像这样（需要扳手）：

在项目解释器select中：~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python
确保将相应的 python 路径添加或更新到 PATH，否则将无法工作。

测试：

尝试安装fiona - 成功，所以对安装没有影响；
尝试了简单的代码：print('HELLO WORLD!') - 有效

已尝试 rdkit 代码

    from rdkit import Chem


    m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')

    print(m)

成功，日志：<rdkit.Chem.rdchem.Mol object at 0x101125080>

Answer 2

另一种选择是在 PyCharm 中创建新项目时 select 现有的虚拟环境。完成 Anna 上面列出的步骤后，“创建项目”屏幕的“先前配置的解释器”部分应该显示 ~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python 作为选项。

如何将 RDKit 添加到 PyCharm 中的项目中？

How to add RDKit to project in PyCharm?

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pycharm

rdkit