如何运行此脚本用于单个根目录下的不同目录？

Question

我里面有一些子目录/home/das/work/

我创建了一个脚本

#!/bin/bash
for i in *_K27me3.bed
do
intersectBed -wa -wb -a $i -b /home/das/work/mm9/mm9_prom_genes_2.5kb.bed | awk -v OFS='\t' {'print ,,,,}' > `basename $i`_prom_genes_2.5kb.txt
done

在目录/home/das/work/

我正在使用以下命令，但它无法工作。我想知道 2 种不同的实现方法，要么使用一个将上述脚本用作函数的脚本，然后每次在父目录的子目录中使用运行s ，或者调用上述脚本分别如下

命令运行假定脚本位于父目录 /home/das/work

for f in *; do [ -d "$f" ] && cd "$f" && ./annotate_prom.sh;done;cd ..

在运行上面的命令出现错误 -clustershell: ./annotate_prom.sh: No such file or directory

Answer 1

交换 done 和 cd 并将 .. 放在脚本路径的开头：

for f in *;做 [ -d "$f" ] && ( cd "$f" && ../annotate_prom.sh );完成

如何 运行 此脚本用于单个根目录下的不同目录？

how to run this script for different directories under a single root?

bash

shell

sh

如何运行此脚本用于单个根目录下的不同目录？