在闪亮的服务器上显示 R 控制台日志

Question

我正在为数据分析操作构建闪亮的应用程序。一切正常。

我想知道有什么方法可以显示日志，即 R Studio 中发生的事情。就像 print() 消息或任何 R 控制台正在打印的消息。我需要在闪亮的应用程序中以交互方式显示所有这些 activity。

就像我们打印进度一样，有什么方法可以附加进度消息而不是显示新消息。

我在 interned 上搜索过，但没有找到这方面的任何信息。

有人做过这种事吗？任何善意的帮助都将不胜感激。

Answer 1

好吧，可能有更好的方法适用于您计算机上的 R & R Shiny 和运行在服务器上的 R Shiny -> library(log4r)

library(log4r)
loggerDebug <- create.logger()
logfile(loggerDebug) <- 'data/debugData.log'
level(loggerDebug) <- 'INFO'

loggerServer <- create.logger()
logfile(loggerServer) <- 'data/serverData.log'
level(loggerServer) <- 'INFO'

# examples of levels
# debug(logger, 'A Debugging Message') # Won't print anything
# info(logger, 'An Info Message')
# warn(logger, 'A Warning Message')
# error(logger, 'An Error Message')
# fatal(logger, 'A Fatal Error Message')

确保在服务器上具有正确的读写权限，否则将无法正常工作。（记住是 R 服务器在写而不是你）

# this depends on your security settings and rights
# talk to your UNIX ADMIN first
test <- list()
test$test <- "test"

# to change in linux / unix 
system("chmod a+rwx /...pathToYourApp..../data")
system("chmod a+rwx /...pathToYourApp..../data/debugData.log")

info(loggerDebug, paste('|   TEST   |',test$test,"|"))

# close after write (for security):
system("chmod u=-x,g-x,o-rwx /...pathToYourApp..../data")
system("chmod u=-x,g-x,o-rwx /...pathToYourApp..../data/debugData.log")

为了更加安全，您可以这样做：

system("chattr +a /...pathToYourApp..../data/debugData.log")

这只允许附加到文件，因此不能对现有内容进行任何修改。（可以帮助说服 UNIX 管理员）

您可以在工作时打开日志文件，如果您使用 RStudio 或使用更动态的自我更新包（如 Sublime Text 或 ....），请务必刷新或重新打开文件

希望对您有所帮助，也许您找到了更好的方法，请告诉我们

Answer 2

相关答案，例如检查具有多个消息的功能日志。

library(shiny)

ui <- fluidPage(
  titlePanel("produce output or message"),
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      radioButtons(inputId = "object",
                   label = "Generate output (or message)",
                   choices = c("cars", "iris")
                   ),
      radioButtons(inputId = "type",
                   label = "Type of capture",
                   choices = c("message", "output")
                   ,selected = "output"
      ),
    ),
    mainPanel(
      uiOutput("main")
      )
    )
)


server <- function(input, output, session) {
  
  values<-reactiveValues()
  
  observeEvent(input$object,{
    filename <- tempfile(fileext=".txt")
    filenamePath <- normalizePath(filename, mustWork = F)
    values[["outfile"]] <- filenamePath
  })
  
  observeEvent(c(input$object,input$type),{
  capture.output(
    # FUNCTION OF INTEREST
    get(input$object)
    ,file= (outfile <- file(values[["outfile"]],"w"))
    ,type=input$type
  )
  close(outfile)
  message(values[["outfile"]]) # for console only
  })
  
  filenameR <- eventReactive(c(input$object, input$type),{
    f<-values[["outfile"]]
  })
  
  output$log <- renderText({
    rawText <- filenameR()
    validate(need(try(readLines(rawText) ), message = FALSE) )
    replacedText <- paste(readLines(rawText), collapse = "\n")
    replacedText <- gsub("\3\[[[:digit:]]{2}m","",replacedText) # removes ansicolor when present
    return(replacedText)
  }
  )
  
  output$main <- renderUI({     
    wellPanel(
    h2("log")
    ,verbatimTextOutput("log")
  ) 
  }) 
}

shinyApp(ui = ui, server = server)

在闪亮的服务器上显示 R 控制台日志

Display R console logs on shiny server

r

shiny