用 R 对 SpatialPolygonsDataFrame 中重叠多边形的属性值求和
Summing values of attributes of overlapping polygons in SpatialPolygonsDataFrame with R
我有一个形状文件,其中包含许多部分重叠的 SpatialPolygons。这些多边形属于杀菌剂在田间的应用,每个多边形都有一个相关的应用率作为属性。
我想要获得的是校正 AsApplied 地图,同时考虑重叠区域,这意味着如果两个(或更多)多边形重叠,则应将速率相加并合并。
以下示例代码创建了一个 SpatialPolygonsDataFrame 来简化问题:
library(raster)
library(sp)
p<-SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(cbind(c(1,4,4,3,3,1,1),c(1,1,3,3,4,4,1)),hole = F)), "1_ "),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(3,4,4,3,3),c(3,3,4,4,3)),hole = F)), "1_2"),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(3,4,4,3,3),c(3,3,4,4,3)),hole = F)), "2_1"),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(4,4,5,5,3,3,4),c(4,3,3,5,5,4,4)),hole = F)),"2_")))
pid <- sapply(slot(p, "polygons"), function(x) slot(x, "ID"))
p.df <- data.frame( ID=1:length(p), row.names = pid)
p <- SpatialPolygonsDataFrame(p, p.df)
p$Rate <- c(100, 100, 100, 100)
crs(p) <- "+proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0"
plot(p)
您可以从四个部分重叠的多边形中看到两个正方形。每个多边形的关联速率为 100。
我想要的是三个多边形。两个不重叠的应该有 100 的比率,两个重叠的应该连接到一个值为 200 的多边形。
我已经尝试了栅格包的联合或相交功能,但只能获得多边形重叠的信息,但不能获得求和和合并的信息。此外,我正在明确寻求 R 中的解决方案。
非常感谢任何解决此问题的帮助。
更新: 下面提供的 RobertH 提供的解决方案适用于我的简单示例。已经非常感谢了!
然而,当切换到我的真实用例时,我遇到了以下类型的错误和警告:
Error in if (is.numeric(i) && i < 0) { :
missing value where TRUE/FALSE needed
In addition: Warning messages:
1: In RGEOSUnaryPredFunc(spgeom, byid, "rgeos_isvalid") :
Too few points in geometry component at or near point 8.3634020800000002 50.056772690000003
...
此处上传了示例形状文件:(已过时)
有什么办法可以解决这个问题吗?
更新 #2 使用当前开发版本 2.5-10 确实修复了 RGEOSUnaryPredFunc 中的警告。但是,如果多边形仅重叠得非常少,我仍然会收到错误消息:
Error in if (is.numeric(i) && i < 0) { :
missing value where TRUE/FALSE needed
此处上传了发生这种情况的示例形状文件:http://www.share-online.biz/dl/O4ZIVH8OBW。更精确的字段如下所示:
标记为红色的两个多边形会导致错误,如果删除两个多边形中的一个,则并集可以正常工作。
非常感谢您的大力帮助!
我想这确实是union
你想要的。它合并并识别重叠的多边形。有了它,您可以对费率求和。
# example data
library(raster)
p1 <- cbind(c(1,4,4,1),c(1,1,4,4))
p2 <- cbind(c(3,5,5,3),c(3,3,5,5))
p <- spPolygons(p1, p2, crs="+proj=longlat +datum=WGS84",
attr=data.frame(ID=1:2, Rate =c(50,100)))
#data.frame(p)
# ID Rate
#1 1 50
#2 2 100
首先使用union
x <- union(p)
ud <- data.frame(x)
ud$count <- NULL
对贡献多边形的比率求和
udRate <- t( t(ud) * p$Rate )
x$Rate <- rowSums(udRate)
data.frame(x)
# ID.1 ID.2 count Rate
#1 1 0 1 50
#2 0 1 1 100
#3 1 1 2 150
我有一个形状文件,其中包含许多部分重叠的 SpatialPolygons。这些多边形属于杀菌剂在田间的应用,每个多边形都有一个相关的应用率作为属性。
我想要获得的是校正 AsApplied 地图,同时考虑重叠区域,这意味着如果两个(或更多)多边形重叠,则应将速率相加并合并。
以下示例代码创建了一个 SpatialPolygonsDataFrame 来简化问题:
library(raster)
library(sp)
p<-SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(cbind(c(1,4,4,3,3,1,1),c(1,1,3,3,4,4,1)),hole = F)), "1_ "),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(3,4,4,3,3),c(3,3,4,4,3)),hole = F)), "1_2"),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(3,4,4,3,3),c(3,3,4,4,3)),hole = F)), "2_1"),
Polygons(list(Polygon(cbind(c(4,4,5,5,3,3,4),c(4,3,3,5,5,4,4)),hole = F)),"2_")))
pid <- sapply(slot(p, "polygons"), function(x) slot(x, "ID"))
p.df <- data.frame( ID=1:length(p), row.names = pid)
p <- SpatialPolygonsDataFrame(p, p.df)
p$Rate <- c(100, 100, 100, 100)
crs(p) <- "+proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0"
plot(p)
您可以从四个部分重叠的多边形中看到两个正方形。每个多边形的关联速率为 100。 我想要的是三个多边形。两个不重叠的应该有 100 的比率,两个重叠的应该连接到一个值为 200 的多边形。
我已经尝试了栅格包的联合或相交功能,但只能获得多边形重叠的信息,但不能获得求和和合并的信息。此外,我正在明确寻求 R 中的解决方案。
非常感谢任何解决此问题的帮助。
更新: 下面提供的 RobertH 提供的解决方案适用于我的简单示例。已经非常感谢了!
然而,当切换到我的真实用例时,我遇到了以下类型的错误和警告:
Error in if (is.numeric(i) && i < 0) { :
missing value where TRUE/FALSE needed
In addition: Warning messages:
1: In RGEOSUnaryPredFunc(spgeom, byid, "rgeos_isvalid") :
Too few points in geometry component at or near point 8.3634020800000002 50.056772690000003
...
此处上传了示例形状文件:(已过时)
有什么办法可以解决这个问题吗?
更新 #2 使用当前开发版本 2.5-10 确实修复了 RGEOSUnaryPredFunc 中的警告。但是,如果多边形仅重叠得非常少,我仍然会收到错误消息:
Error in if (is.numeric(i) && i < 0) { :
missing value where TRUE/FALSE needed
此处上传了发生这种情况的示例形状文件:http://www.share-online.biz/dl/O4ZIVH8OBW。更精确的字段如下所示:
标记为红色的两个多边形会导致错误,如果删除两个多边形中的一个,则并集可以正常工作。
非常感谢您的大力帮助!
我想这确实是union
你想要的。它合并并识别重叠的多边形。有了它,您可以对费率求和。
# example data
library(raster)
p1 <- cbind(c(1,4,4,1),c(1,1,4,4))
p2 <- cbind(c(3,5,5,3),c(3,3,5,5))
p <- spPolygons(p1, p2, crs="+proj=longlat +datum=WGS84",
attr=data.frame(ID=1:2, Rate =c(50,100)))
#data.frame(p)
# ID Rate
#1 1 50
#2 2 100
首先使用union
x <- union(p)
ud <- data.frame(x)
ud$count <- NULL
对贡献多边形的比率求和
udRate <- t( t(ud) * p$Rate )
x$Rate <- rowSums(udRate)
data.frame(x)
# ID.1 ID.2 count Rate
#1 1 0 1 50
#2 0 1 1 100
#3 1 1 2 150