如何搜索子序列

Question

我想在数据库 table 和 return 中搜索作为另一个字符串的子序列的任何字符串。

当我想搜索与另一个字符串相等的字符串时，我使用以下命令：

SELECT kmer from data where kmer="ATCG"

假设 kmer = "ATCG"，将进行匹配。但是，如果我想作为子序列进行搜索怎么办？类似于以下内容：

SELECT kmer from data where kmer in "XXATCGXX"

但显然，这种语法是不正确的。这些字符串是静态的，我无法在 LIKE 语法中使用通配符。

明确地说，以下任何值都应该 return 匹配：

X
XX
XAT
XATC
ATC
TC
GX
CGXX
A
T
C
G

仅举几个例子。这些都是 "XXATCGXX" 的子序列，所以我可以使用 wildcats 来涵盖所有这些可能性吗？

Answer 1

LIKE 通常与左边的列值一起使用，但正如三十二上校所说，您可以反转比较：

SELECT kmer FROM data WHERE 'XXATCGXX' LIKE '%' || kmer || '%';

How to search as subsequence