使用 ggplot2 在分离的小提琴图上叠加散点

Question

我按照在 2x2 设计中生成分割小提琴图的好答案

现在假设这些数据来自不同受试者的重复测量。此外，我想在散点图中绘制单个数据（我知道该图可能最终会太忙，我想先看看）。

我快完成了，但是有一个小错误可能很容易修复。我包括一个完整的工作示例，以防有更好的方法来做到这一点。

这第一部分是我直接从上一个问题复制过来的：

library(dplyr)
library(ggplot2)

set.seed(20160229)

我将 subj 添加到我的数据框中，因为我想绘制每个对象的平均值

my_data = data.frame(
  y=c(rnorm(1000), rnorm(1000, 0.5), rnorm(1000, 1), rnorm(1000, 1.5)),
  x=c(rep('a', 2000), rep('b', 2000)),
  m=c(rep('i', 1000), rep('j', 2000), rep('i', 1000)),
  subj=c(rep(c(rep('1',200),rep('2',200),rep('3',200),rep('4',200),rep('5',200)),4))
)

pdat <- my_data %>%
  group_by(x, m) %>%
  do(data.frame(loc = density(.$y)$x,
                dens = density(.$y)$y))

pdat$dens <- ifelse(pdat$m == 'i', pdat$dens * -1, pdat$dens)
pdat$dens <- ifelse(pdat$x == 'b', pdat$dens + 1, pdat$dens)


ggplot(pdat, aes(dens, loc, fill = m, group = interaction(m, x))) + 
  geom_polygon() +
  scale_x_continuous(breaks = 0:1, labels = c('a', 'b')) +
  ylab('density') +
  theme_minimal() +
  theme(axis.title.x = element_blank())

到目前为止，效果很好。现在我尝试为每个主题添加我的平均值

meanY = aggregate(y ~ x + m + subj, my_data, mean, drop=TRUE)


ggplot(pdat, aes(dens, loc, fill = m, group = interaction(m, x))) + 
  geom_polygon() +
  geom_point(data=meanY, aes(fill = m, group = interaction(m, x))) +
  scale_x_continuous(breaks = 0:1, labels = c('a', 'b')) +
  ylab('density') +
  theme_minimal()

我收到错误：Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'dens' not found

Answer 1

如果我理解正确，您需要在 geom_point 中指定 x 和 y:

ggplot(pdat, aes(dens, loc, fill = m, group = interaction(m, x))) + 
  geom_polygon() +
  scale_x_continuous(breaks = 0:1, labels = c('a', 'b')) +
  ylab('density') +
  theme_minimal() +
  theme(axis.title.x = element_blank()) +
  geom_point(data = meanY, aes(x = ifelse(x == "a", 0, 1), y = y, fill = m, group = interaction(m, x)), shape = 21, colour = "black", show.legend = FALSE)

使用 ggplot2 在分离的小提琴图上叠加散点

Overlay scatterpoints on split violin plot with ggplot2

r

scatter-plot

ggplot2

violin-plot