每分钟安排一个 R 脚本 crontab

Question

出于某种原因，我的 R 脚本不会 运行 带有 crontab。我现在每分钟都有它进行测试，但一旦它起作用就会改变它。

有什么想法吗？

* * * * * Rscript “/Users/Home/Desktop/David Studios/Scraper/compiler.R”

此外，这只是终端中的一个普通命令。

Answer 1

我可以在你的 cron 条目中看到可怕的 smart quotes。当您从文字处理器复制粘贴时，经常会发生这种情况。在这些令人厌恶的地方退格并重新输入正常引号。变化：

* * * * * Rscript “/Users/Home/Desktop/David Studios/Scraper/compiler.R”

至

* * * * * Rscript "/Users/Home/Desktop/David Studios/Scraper/compiler.R"

看出区别了吗？它很微妙，很容易错过。

更新：

我看到您已经进行了上述更改，但它仍然不适合您。验证 Rscript 是否在拥有此 crontab 的用户的 $PATH 环境变量中。或者，您可以直接在 cron 条目中指定 Rscript 的完全限定路径。您可以使用以下命令在命令行上快速找到它：

which Rscript

更新#2：

我从您的评论中看到 Rscript 的完全限定路径是 /usr/local/bin/Rscript。我猜 /usr/local/bin 不在拥有此 crontab 的用户的路径中。尝试使用完全限定路径，如下所示：

* * * * * /usr/local/bin/Rscript "/Users/Home/Desktop/David Studios/Scraper/compiler.R"

Answer 2

检查你是否真的是 运行 crontab 守护进程。您应该得到一个数字 return，这是 crontab 的进程 ID。

pgrep cron

确保您的 R 文件是可执行的：

sudo chmod +x [yourfile.R]

在您的 R 文件中添加 shebang 行：

#!/usr/local/bin/Rscript

让 crontab 做目录的改变：

* * * * * cd /Users/Home/Desktop/David Studios/Scraper/ && /usr/local/bin/Rscript compiler.R

Answer 3

您可能对 R 中的工作目录有疑问。

当您从终端 运行 脚本时，您可能位于脚本所需文件所在的目录中，但是当脚本 运行 带有 cron 时，它使用另一个目录。

在访问文件时使用 R 脚本中的 setwd() 函数或使用绝对路径，以确保脚本无论在何处使用都能正常工作。