如何指定 rmarkdown 使用 Python3 而不是 Python 2？

Question

我正在尝试运行 python 作为 rmarkdwon 代码块。我成功了，但默认情况下 rmarkdown 使用 Python2，我希望它使用 Python 3。我运行在 Ubuntu 上使用 Python 2.7.6安装并且我用 Python 3.5 安装了 anaconda，这是我想要 rmarkdown 使用的版本。

这是 rmarkdown

中 python 块的代码和输出

import sys
print (sys.version)

和输出：

2.7.6 (default, Jun 22 2015, 17:58:13)

有什么想法吗？

Answer 1

您可以添加 engine.path = '/path/to/python3' 来覆盖 python (2) 可执行文件。例如，

---
title: "python"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{python}
import sys
print(sys.version)
```

```{python, engine.path = '/usr/bin/python3'}
import sys
print(sys.version)
```

Answer 2

您可以 select 您想要的 python 版本，默认情况下，带有 R 块：

```{r setup, echo=FALSE}
library(knitr)
opts_chunk$set(engine.path = '/usr/bin/python3')
```

从现在开始，您的 python 块将使用 Python3:

```{python}
import sys
print(sys.version)
```

这种 select python 版本的方式避免了将 engine.path 变量添加到每个代码块。

Answer 3

实际上，如果您是运行ning Python 3.x，我就是，我必须执行以下操作（显然是 Python3 可执行文件的路径可能不同）：

```{r Setup, echo=FALSE}
library(knitr)
opts_chunk$set('python', engine.path='/usr/local/Cellar/python3/3.6.3/bin/python3')

```

然后可以只使用 python 创建一个块，它会运行在正确的版本中：

```{python, cache=TRUE, echo = FALSE, eval = TRUE}

import sys
print(sys.version)

```

Answer 4

可以使用reticulate包，在开头插入R块：

```{r}
library(reticulate)
use_python("/usr/local/bin/python3")
```

如何指定 rmarkdown 使用 Python3 而不是 Python 2？

How can I specify rmarkdown to use Python3 instead of Python 2?

r

r-markdown

python-3.5