如何使用嵌套循环从 Python 中的多行中提取列？

Question

我有一个包含 3 个序列的列表

seq_list = ['ACGT', 'ATTT', 'ACCC']

我想从列表中提取列并使用 python

中的嵌套循环将其存储在另一个列表中

最终输出应该是

seq_list = ['AAA', 'CTC', 'GTC','TTC']

我已经编写了以下代码，但它没有产生所需的输出。

column = []
for i in range(len(seq_list[0])):   #Length of the row
    for j in range(len(seq_list)):    #Length of the column
        column.append(seq_list[j][i])
         print column

Answer 1

或者，您可以 "zip" the sequence and join:

>>> [''.join(item) for item in zip(*seq_list)]
['AAA', 'CTC', 'GTC', 'TTC']

Answer 2

通过你的方法我做了一点修改，对于每个内部 for 循环我创建了一个 string 然后在内部 for 循环结束后我将它附加到 column :

seq_list = ['ACGT', 'ATTT', 'ACCC']
column = []
for i in range(len(seq_list[0])):   #Length of the row
    string = ""
    for j in range(len(seq_list)):    #Length of the column
        string += seq_list[j][i]
    column.append(string)
print column

输出：

['AAA', 'CTC', 'GTC', 'TTC']

尽管您可以使用@alecxe 代码（使用zip 和join）。我认为它很酷而且更像 pythonic。

Answer 3

new_seq_list = reduce(
  lambda new_seq_list,item:
    new_seq_list + [''.join([item.pop(0) for item in new_seq_list[0]])]
  , range(max([len(item) for item in seq_list])) ,
  [[list(item) for item in seq_list]]
)[1:]

将原始列表转换为字符列表而不是字符串列表
为最长字符串中的每个字符减少该列表一次
每次减少，将一个字符串添加到新列表中，该字符串由从每个字符列表中删除的第一项组成，并连接在一起。
最后，从序列的开头删除现在为空的列表。

如何使用嵌套循环从 Python 中的多行中提取列？

How to extract columns from multiple rows in Python using nested loops?

python

for-loop

extract

multiple-columns

python-2.7