使用 vispy 的神经图像数据的体素表示

voxel representation of neural image data using vispy

我有大脑神经元的荧光成像数据,它基本上是由其体素定义的 3D 图像。我想使用 vispy 显示它以显示深度并能够从各个方向旋转和查看数据。

我不想要投影,但想将每个像素表示为一个点并使用 vispy 显示它们。 我研究了如何使用 vispy 显示点。 http://vispy.org/examples/basics/gloo/display_points.html

我的想法是用图像的大小(x*y)作为顶点的位置,用像素数据作为顶点的颜色。但是我无法实现我想要的。 我是 openGl/vispy 的新手。如有任何建议或想法,我们将不胜感激!

Vispy 中的体积渲染正在制作中:https://github.com/vispy/vispy/pull/612此 PR 应在两周内合并。