在给定的 conda 环境中执行 python 脚本的最佳方式

Question

我想使用 subprocess 包从另一个 python 脚本 trigger.py 执行一个 python 脚本 executed.py。 executed.py 在与 trigger.py 不同的 conda 环境中必须是运行（比方说 executed_env 和 trigger_env)。最好的方法是什么？我当前的 trigger.py 代码是：

command = "python executed.py --option1 -dir /path/to/dir"
args = shlex.split(command)
my_subprocess = subprocess.Popen(args)

它 returns 一个错误，因为 executed.py 在 trigger_env 环境中是运行。

Answer 1

如果您只需要使用另一个 python，那么我相信您只需要在 command 中使用另一个 python 的完整路径。

尝试进入您的 executed_env（即 source activate executed_env 如果 Linux）并执行 which python。让我们假设 returns HOME/.conda/envs/executed_env/bin/python 现在变成您在命令中使用的 python —— 即 command = "HOME/.conda/envs/executed_env/bin/python executed.py --option1 -dir /path/to/dir"。这个

例如，我们运行 executed.py 在不同的 python 版本中。

创建你的py27环境conda create -n py27 python=2.7这是trigger_env。
创建你的py35环境conda create -n py35 python=3.5这是executed_env。
通过运行ning source activate py35 然后 which python 获取 py35 的完整 python 路径（我们称其为 EXECUTED_PYTHON 以进行描述）。通过 source deactivate.
然后我们创建executed.py
```
import sys
print(sys.version)
```

然后是 trigger.py（包括参数，但它们什么也没做）

command = "EXECUTED_PYTHON executed.py --option1 -dir /path/to/dir"
args = shlex.split(command)
my_subprocess = subprocess.Popen(args)

现在让我们运行它在 trigger_env -- source activate py27 和 python trigger.py.
这会打印出 3.5.2 |Continuum Analytics, Inc. [...]（3.5 是重要部分）。您可以看到它正在使用 executed_env.

Answer 2

我对任何 conda 内置方法进行了一些研究，发现了以下内容。第一个是解决方法，第二个是最终解决方案内置解决方案（在撰写本文时不可用 post）。

conda-wrappers。 Guilherme Melo 在 conda 环境中为 python 可执行文件创建了一个包装器。如果您在 IDE 中将其设置为 python 解释器，例如PyCharm，它将激活调用它的 conda 环境，然后调用 python 解释器。在 "Creating conda wrappers" 部分下查看此处： https://pypi.org/project/exec-wrappers/
conda 运行。在 a standard and fast way to execute a command inside an environment 上的 conda github 页面上进行了长时间的讨论，导致实施了一个新命令（实际上是重新调用，因为它以前可用）： conda run

希望在 2018 年 10 月issue #7320 and will be released in conda-4.6中描述！

Answer 3

在 windows 环境中使用 conda，我只是复制了 conda 从不同环境启动不同 jupyter 笔记本的方式。所有快捷方式都使用“C:\ProgramData\Anaconda3\python.exe”调用“C:\ProgramData\Anaconda3\cwp.py”脚本，然后您可以使用其他参数选择要执行的环境和文件。

在我的例子中，环境名称= AutomateXXReporting，要执行的文件= C:\Users\ismael.serrano\Documents\GIT\xxx\notebooks\exports\get_JIRA_user_streams.py

C:\ProgramData\Anaconda3\python.exe C:\ProgramData\Anaconda3\cwp.py C:\Users\ismael.serrano\.conda\envs\AutomateXXReporting C:\Users\ismael.serrano\.conda\envs\AutomateXXReporting\python.exe C:\Users\ismael.serrano\Documents\GIT\xxx\notebooks\exports\get_JIRA_user_streams.py

之前我已经按照 Paul 的指示成功进行了，但是遇到了一个不充分的情况。完整路径中的 python 无法找到一些库，使用 cwp.py 它可以工作。

在给定的 conda 环境中执行 python 脚本的最佳方式

Best way to execute a python script in a given conda environment

python

environment

subprocess

conda