matplotlib 慢速 3D 散点旋转

Question

我正在使用 matplotlib 散点图绘制 3D 点矩阵。我正在使用以下代码：

import pylab as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import numpy as np

my_data = np.random.rand(6500,3)  # toy 3D points

fig = plt.figure()
ax = Axes3D(plt.gcf())
ax.scatter(my_data[:,0],my_data[:,1],my_data[:,2])
plt.show()

它起作用了，所以它会打开一个 window，我可以在其中查看我的点数。

但是，如果我尝试用鼠标旋转绘图（单击并拖动它），它旋转得非常慢。

我认为 6500 点对于如此缓慢和滞后的旋转来说并不多，所以我想知道是否有任何预配置可以加快速度。

注意：我尝试使用 Matlab，我可以旋转更大的散点图而没有任何延迟，所以这不是计算机限制。

谁能运行这个代码，看看是否也遇到了慢速旋转？

编辑：使用系统监视器我可以看到在旋转点时，只使用了一个 CPU，所以 matplotlib 没有并行化这个过程。

我的电脑规格：

英特尔(R) 酷睿(TM) i5-3550 CPU @ 3.30GHz
显卡：Xeon E3-1200 v2/3rd Gen Core 处理器图形控制器
内存：10GB RAM
硬盘：三星固态硬盘 500 GB

运行宁Ubuntu16.10

Answer 1

（2021 年修订）

Matplotlib 并不是真正为交互而设计的。 Plotly（以及其他一些）是一个功能相当完整的绘图包，并为 scatter3D 使用 webGL 后端，它将在您的浏览器中呈现（并且速度非常快）。更多关于为什么您可能想将其视为底部的首选替代品：

# pip install plotly
import numpy as np
import plotly.graph_objects as go

my_data = np.random.rand(6500,3)  # toy 3D points
marker_data = go.Scatter3d(
    x=my_data[:,0], 
    y=my_data[:,1], 
    z=my_data[:,2], 
    marker=go.scatter3d.Marker(size=3), 
    opacity=0.8, 
    mode='markers'
)
fig=go.Figure(data=marker_data)
fig.show()

我使用 plotly 作为 matplotlib 的替代品，因为：

覆盖面广（条形图、散点图、线形图、柱状图等）
高度可配置的直观交互组件
可移植性：它可以生成 html 图表，可以轻松地通过网络查看 (!) 或保存为静态文件格式
它比 matplotlib 更清晰api（对于完整配置，json大概）
它与 pandas 紧密集成（您可以 use it as the backend）
它得到了很好的支持并且采用率正在增加

matplotlib 慢速 3D 散点旋转

matplotlib Slow 3D scatter rotation

python

matplotlib

scatter-plot