从源重新加载自定义 R 包
Reload Custom R Package from Source
我已经创建了一个自定义包并想将它部署到远程机器上。这是我当前的长工作流程:
- 创建自定义包'my_package_0.1.0.tar.gz'
- scp 包到远程机器
- 创建远程会话
install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
library('my_package')
当其他人连接到机器时,他们必须运行安装和库:
install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
library('my_package')
有什么方法可以共享自定义包并让工作流程成为:
- 创建远程会话
- 使用
library('my_package')
加载包
评论中的反馈说最佳做法是将软件包安装在共享位置。
这是找到安装软件包的好地方的方法。
运行 下面显示从哪里加载库
.libPaths()
# rserve2 rserve2 /opt/deployr/9.0.1/rserve/R
#root root /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/library
R 服务器在两个位置寻找库。一个归 root 所有,所以我们不应该部署在这里。另一个位置 rserve2 拥有所有权并且看起来很有前途。我们应该创建一个 library
子文件夹来存储共享包。
根据此信息,工作流程应为:
- 创建自定义包'my_package_0.1.0.tar.gz'
- scp 包到远程机器
- 创建远程会话
- install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz", lib='/opt/deployr/9.0.1/rserve/R/library/' )
- 图书馆('my_package')
当其他人连接到本机时,他们可以加载共享库:
- 图书馆('my_package')
我已经创建了一个自定义包并想将它部署到远程机器上。这是我当前的长工作流程:
- 创建自定义包'my_package_0.1.0.tar.gz'
- scp 包到远程机器
- 创建远程会话
install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
library('my_package')
当其他人连接到机器时,他们必须运行安装和库:
install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
library('my_package')
有什么方法可以共享自定义包并让工作流程成为:
- 创建远程会话
- 使用
library('my_package')
加载包
评论中的反馈说最佳做法是将软件包安装在共享位置。
这是找到安装软件包的好地方的方法。
运行 下面显示从哪里加载库
.libPaths()
# rserve2 rserve2 /opt/deployr/9.0.1/rserve/R
#root root /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/library
R 服务器在两个位置寻找库。一个归 root 所有,所以我们不应该部署在这里。另一个位置 rserve2 拥有所有权并且看起来很有前途。我们应该创建一个 library
子文件夹来存储共享包。
根据此信息,工作流程应为:
- 创建自定义包'my_package_0.1.0.tar.gz'
- scp 包到远程机器
- 创建远程会话
- install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz", lib='/opt/deployr/9.0.1/rserve/R/library/' )
- 图书馆('my_package')
当其他人连接到本机时,他们可以加载共享库:
- 图书馆('my_package')