R中两个数据框的箱线图
boxplots from two dataframes in R
我想根据 R 中的 两个不同的数据帧 创建一个箱线图。在每个数据帧中，行代表样本。而列代表疾病。箱线图分布应该由每一行中的值组成。数据应该显示每个数据帧（控制组、实验组）中行分布之间的比较。所以如果每个数据框有6行，那么应该有12个框。
它应该看起来像这样。
https://i.stack.imgur.com/17OIk.png
两个数据框的行数相同，但列数不同，因为实验条件不同。我还希望按仅 一个 数据帧的行中位数对图进行重新排序，并且应为整个箱形图保留此顺序。
有什么想法吗？？我是 R 的新手，非常感谢任何线索。
生成一些示例数据
df1 <- data.frame(disease.a=rnorm(10,2),
disease.b=rnorm(10,2),
disease.c=rnorm(10,2)) # experimental group
df2 <- data.frame(disease.a=rnorm(10,0),
disease.b=rnorm(10,0),
disease.c=rnorm(10,0)) # control group
在 df1 和 df2 中添加一列来表示实验条件
df1$condition <- "experimental"
df2$condition <- "control"
将您的数据框绑定在一起
df3 <- rbind(df1, df2)
重塑数据
library(reshape2)
m.df <- melt(df3, id.var="condition")
根据您的示例使用 ggplot 绘制数据
library(ggplot2)
ggplot(m.df, aes(x=condition, y=value)) + geom_boxplot(aes(fill=variable))
我想根据 R 中的 两个不同的数据帧 创建一个箱线图。在每个数据帧中，行代表样本。而列代表疾病。箱线图分布应该由每一行中的值组成。数据应该显示每个数据帧（控制组、实验组）中行分布之间的比较。所以如果每个数据框有6行，那么应该有12个框。
它应该看起来像这样。 https://i.stack.imgur.com/17OIk.png
两个数据框的行数相同，但列数不同，因为实验条件不同。我还希望按仅 一个 数据帧的行中位数对图进行重新排序，并且应为整个箱形图保留此顺序。
有什么想法吗？？我是 R 的新手，非常感谢任何线索。
生成一些示例数据
df1 <- data.frame(disease.a=rnorm(10,2),
disease.b=rnorm(10,2),
disease.c=rnorm(10,2)) # experimental group
df2 <- data.frame(disease.a=rnorm(10,0),
disease.b=rnorm(10,0),
disease.c=rnorm(10,0)) # control group
在 df1 和 df2 中添加一列来表示实验条件
df1$condition <- "experimental"
df2$condition <- "control"
将您的数据框绑定在一起
df3 <- rbind(df1, df2)
重塑数据
library(reshape2)
m.df <- melt(df3, id.var="condition")
根据您的示例使用 ggplot 绘制数据
library(ggplot2)
ggplot(m.df, aes(x=condition, y=value)) + geom_boxplot(aes(fill=variable))