在 R 中从 [包] 导入 [函数]

Question

使用 Python 或 R 中的数据，我们经常加载多个包。在某些情况下，两个包（例如 foo 和 bar）可能每个都包含一些功能（例如 do_stuff）。

在 Python 中为防止歧义或意外而进行管理的方式如下：

from foo import do_stuff
from bar import other_function    # (does not load/import do_stuff() from bar)

在 R 中，我看到的所有代码都只导入了整个包多个 library(package_name) 语句。我认为这会导致非常难以捕获的错误。例如，参见 Reordering factor gives different results, depending on which packages are loaded。事实上，即使 "there is no masking, since reorder.factor doesn't exist in base."

我希望这个问题的一般答案类似于上面的 from package import function 代码，但事实并非如此。事实上，接受的（也是唯一的）答案只是解释了问题存在的原因（而不是淡化该贡献）。答案的评论中提供了一个解决方法，但该解决方法特定于该特定函数 (reorder)。

有没有一种通用的方法可以只从 R 中的特定包导入特定函数？这样我就可以慎重而明确地知道我代码中所有函数调用的来源，并确保它们按照我认为的方式进行？

Answer 1

您可以使用 package::function() 构造明确告诉 R 应该将哪个包用于给定函数。您甚至可以使用它来调用尚未加载 library.

的包中的函数

library(dplyr) # Has a function called filter()
library(plyr) # Also has a filter() function

dplyr::filter(foo)
plyr::filter(bar)

如果您想确保将代码中出现混淆的可能性降至最低，我强烈推荐 conflicted 包，它会强制您明确识别所有不明确的函数调用的包：https://www.tidyverse.org/articles/2018/06/conflicted/

Answer 2

您正在比较两种功能不同的语言。首先，您可以使用 :: 轻松引用包中的函数，例如：

fortunes::fortune()

从 fortunes 包中调用 fortune 函数。

但你也必须小心。因为根据包的构建方式，您最终可能会使用依赖于命名空间中其他（非导出）函数的函数，但由于未加载命名空间而无法找到。我已经运行自己使用 mgcv 包中的绘图函数解决了这个问题。这是使用 library() 附加包的原因之一，正如 Andrew Breza 在他的回答中所说明的那样。至少您使用 :: 构造调用的函数将按预期工作（99.9% 的时间）。

但是您link遇到的问题，这并不能解决。问题是 "bad design"，因为包作者决定他需要一个 S3 方法来重新排序一个因子，而不是特定于他的包的 class。这样做为整个因子 class 注册了一个 S3 方法，因此改变了在一个因子上调用 reorder() 的每个函数的行为。

由于这个问题是由包开发人员自己造成的，作为用户，除了自己侵入 S3 系统以找到您需要的实际方法之外，您几乎无能为力。

Answer 3

虽然的答案是正确的，但它不适用于 magrittr 的 %>% 和 %$% 等中缀运算符。 import 包很好用：

import::from(magrittr, "%$%")

但显然可以用于任何函数:

import::from(foo, "do_stuff", "do_other_stuff")

请注意，“[import] 不适用于 library。它的命名是为了让 import::from(pkg, fun1, fun2) 这样的调用更具表现力。”有关详细信息，请参阅 https://CRAN.R-project.org/package=import。

Answer 4

从 R 4.0 开始，您还可以使用主 library() 函数执行此操作：

library(dplyr, include.only = c("select", "mutate"))
library(dplyr, exclude = c("filter", "lag"))

Answer 5

基于 wjchulme 的，导入包还允许您从自己的脚本中导入函数或其他对象，使 R 具有模块化的感觉，很像 python 模块。

import::from(your_script.R, some_function, SOME_CONSTANT, and_whatever)

参考：https://cran.r-project.org/web/packages/import/vignettes/import.html

在 R 中从 [包] 导入 [函数]

From [package] import [function] in R

encapsulation

namespaces

r

function