在 Psycopg2 中高效地插入大量行

Efficiently insert massive amount of rows in Psycopg2

我需要高效地将大约 500k(大约 100k)行数据插入到我的 PostgreSQL 数据库中。经过大量 google-ing,我得到了这个解决方案,平均大约 150(挂钟)秒。

def db_insert_spectrum(curs, visual_data, recording_id):
    sql = """
        INSERT INTO spectrums (row, col, value, recording_id)
        VALUES %s
    """

    # Mass-insertion technique
    # visual_data is a 2D array (a nx63 matrix)
    values_list = []
    for rowIndex, rowData in enumerate(visual_data):
        for colIndex, colData in enumerate(rowData): # colData is the value
            value = [(rowIndex, colIndex, colData, recording_id)]
            values_list.append(value)

    psycopg2.extras.execute_batch(curs, sql, values_list, page_size=1000)

有没有更快的方法?

我不知道 .execute_batch 是否可以接受生成器,但是你可以试试这样的东西吗:

def db_insert_spectrum(curs, visual_data, recording_id):
    sql = """
        INSERT INTO spectrums (row, col, value, recording_id)
        VALUES %s
    """
    data_gen =  ((rIdx, cIdx, value, recording_id) for rIdx, cData in enumerate(visual_data) 
                                               for cIdx, value in enumerate(cData))
    psycopg2.extras.execute_batch(curs, sql, data_gen, page_size=1000)

它可能会更快。

基于answers given here, COPY是最快的方法。 COPY 从文件或类文件对象中读取。

因为内存 I/O 是 many orders of magnitude faster than disk I/O, it is faster to write the data to a StringIO 类文件对象而不是写入实际文件。 psycopg 文档显示了使用 StringIO 作为输入调用 copy_from 的示例。

因此,您可以使用类似的东西:

try:
    # Python2
    from cStringIO import StringIO 
except ImportError:
    # Python3
    from io import StringIO

def db_insert_spectrum(curs, visual_data, recording_id):
    f = StringIO()
    # visual_data is a 2D array (a nx63 matrix)
    values_list = []
    for rowIndex, rowData in enumerate(visual_data):
        items = []
        for colIndex, colData in enumerate(rowData): 
            value = (rowIndex, colIndex, colData, recording_id)
            items.append('\t'.join(map(str, value))+'\n')
        f.writelines(items)
    f.seek(0)
    cur.copy_from(f, 'spectrums', columns=('row', 'col', 'value', 'recording_id'))