在没有当前行的情况下使用 rollaply

Question

我有一个简单的 data.frame，我想在其中滚动计算一些摘要统计信息。例如，window 的五个观测值（2 个滞后，当前一个和 2 个超前）的滚动中位数是通过

实现的

library(dplyr)
x <- data.frame("vals" = rnorm(3e04))
y <- x %>%
         mutate(med5 = rollapply(data = vals, 
                width = 5, 
                FUN = median, 
                align = "center", 
                fill = NA, 
                na.rm = TRUE))

但是，我想从该计算中排除当前行。我找到了以下方法：

z <- x %>% 
      mutate(N=1:n()) %>% 
      do(data.frame(., prmed = sapply(.$N, function(i) median(.$vals[.$N %in% c((i - 2):(i - 1), (i + 1):(i + 2))]))))

这就是我想要的，如果我随后将前两个值设置为 NA。

到目前为止一切顺利，唯一的问题是后一种方法与 rollapply 相比非常慢。

有没有办法以前者的速度达到后者的结果？

Answer 1

基于排除五个中的第三个数字的解决方案，这是计算的当前行。

library(dplyr)
library(zoo)

set.seed(124)

x <- data.frame("vals" = rnorm(3e04))
y <- x %>%
  mutate(med5 = rollapply(data = vals, 
                          width = 5, 
                          FUN = function(x) median(x[-3], na.rm = TRUE), 
                          align = "center", 
                          fill = NA))

head(y)
#          vals      med5
# 1 -1.38507062        NA
# 2  0.03832318        NA
# 3 -0.76303016 0.1253147
# 4  0.21230614 0.3914015
# 5  1.42553797 0.4562678
# 6  0.74447982 0.4562678

Answer 2

rollapply 的 width= 参数可以是包含偏移向量的单元素列表。

y <- x %>%
  mutate(med5 = rollapply(data = vals, 
                          width = list(c(-2, -1, 1, 2)),
                          FUN = median,
                          na.rm = TRUE,
                          fill = NA))

请注意，align = "center" 是默认值，因此不必指定。此外，如果我们使用偏移量，则 align= 将被忽略。为了安全起见，TRUE 应该写完整，因为 T 也可以是变量名。

在没有当前行的情况下使用 rollaply

use rollaply without current row

r

apply

dataframe

dplyr

rollapply