通过 R 中的图表可视化两个离散变量之间的关联

Question

假设有两个变量（state 和 group）。 state (s) 的实例可能与 group (g) 的特定实例共享属性 .例如，s1、s2 和 s3 可能与 g1[ 有关联=29=].

我想以如下图所示的图表形式可视化两个变量之间的关联：

我想用 R 生成这样的图表。你会推荐我使用什么 R 包？

Answer 1

根据lukeA的建议，我想出了以下代码来解决上述需求。

在Shell中：

$ cat table
s1  g1
s2  g1
s3  g1
s4  g2
s5  g2
s6  g2
s7  g3
s8  g4
s9  g5
s10 g5

在 R 中：

library(igraph)

# Reading data from file
m <- as.matrix(read.table(file="~/Desktop/table", sep="\t"))

# Generating igraph
g <- graph_from_edgelist(m, directed=FALSE)
V(g)$type <- bipartite.mapping(g)$type
coords <- layout_as_bipartite(g)

# Plotting operations
plot.igraph(g, layout = -coords[,2:1]) # Preliminary plotting (why necessary?)
plot.igraph(g, layout = -coords[,2:1],
    vertex.shape="rectangle", # For vertex.foo and edge.foo commands, see: http://igraph.org/r/doc/plot.common.html
    vertex.size=50,
    vertex.size2=20,
    vertex.color=NA,
    vertex.label.color= "black")

# Adding title to plot
title("My first igraph")

通过 R 中的图表可视化两个离散变量之间的关联

Visualizing an association btw two discrete variables via diagram in R

diagram

r