Spark 中的 StandardScaler 未按预期工作

Question

知道为什么 spark 会为 StandardScaler 这样做吗？根据 StandardScaler 的定义：

The StandardScaler standardizes a set of features to have zero mean and a standard deviation of 1. The flag withStd will scale the data to unit standard deviation while the flag withMean (false by default) will center the data prior to scaling it.

>>> tmpdf.show(4)
+----+----+----+------------+
|int1|int2|int3|temp_feature|
+----+----+----+------------+
|   1|   2|   3|       [2.0]|
|   7|   8|   9|       [8.0]|
|   4|   5|   6|       [5.0]|
+----+----+----+------------+

>>> sScaler = StandardScaler(withMean=True, withStd=True).setInputCol("temp_feature")
>>> sScaler.fit(tmpdf).transform(tmpdf).show()
+----+----+----+------------+-------------------------------------------+
|int1|int2|int3|temp_feature|StandardScaler_4fe08ca180ab163e4120__output|
+----+----+----+------------+-------------------------------------------+
|   1|   2|   3|       [2.0]|                                     [-1.0]|
|   7|   8|   9|       [8.0]|                                      [1.0]|
|   4|   5|   6|       [5.0]|                                      [0.0]|
+----+----+----+------------+-------------------------------------------+

在 numpy 的世界里

>>> x
array([2., 8., 5.])
>>> (x - x.mean())/x.std()
array([-1.22474487,  1.22474487,  0.        ])

在 sklearn 世界

>>> scaler = StandardScaler(with_mean=True, with_std=True)
>>> data
[[2.0], [8.0], [5.0]]
>>> print(scaler.fit(data).transform(data))
[[-1.22474487]
 [ 1.22474487]
 [ 0.        ]]

Answer 1

您的结果与预期不符的原因是pyspark.ml.feature.StandardScaler使用无偏样本标准差而不是总体标准差。

来自文档：

The “unit std” is computed using the corrected sample standard deviation, which is computed as the square root of the unbiased sample variance.

如果您使用示例标准差尝试 numpy 代码，您会看到相同的结果：

import numpy as np

x = np.array([2., 8., 5.])
print((x - x.mean())/x.std(ddof=1))
#array([-1.,  1.,  0.])

从建模的角度来看，这几乎肯定不是问题（除非您的数据是整个人口，这几乎永远不会是这种情况）。还要记住，对于大样本量，样本标准差接近总体标准差。所以如果你的 DataFrame 中有很多行，这里的差异可以忽略不计。

但是，如果您坚持让缩放器使用总体标准差，一种 "hacky" 方法是向您的 DataFrame 添加一行，即列的平均值。

回想一下，标准差定义为均值差的平方和的平方根。或者作为函数：

# using the same x as above
def popstd(x): 
    return np.sqrt(sum((xi - x.mean())**2/len(x) for xi in x))

print(popstd(x))
#2.4494897427831779

print(x.std())
#2.4494897427831779

使用无偏标准差时的区别只是除以 len(x)-1 而不是 len(x)。因此，如果您添加了一个等于平均值的样本，您将增加分母而不影响总体平均值。

假设您有以下 DataFrame：

df = spark.createDataFrame(
    np.array(range(1,10,1)).reshape(3,3).tolist(),
    ["int1", "int2", "int3"]
)
df.show()
#+----+----+----+
#|int1|int2|int3|
#+----+----+----+
#|   1|   2|   3|
#|   4|   5|   6|
#|   7|   8|   9|
#+----+----+----+

将此 DataFrame 与每列的平均值合并：

import pyspark.sql.functions as f
# This is equivalent to UNION ALL in SQL
df2 = df.union(df.select(*[f.avg(c).alias(c) for c in df.columns]))

现在调整你的价值观：

from pyspark.ml.feature import VectorAssembler, StandardScaler
va = VectorAssembler(inputCols=["int2"], outputCol="temp_feature")

tmpdf = va.transform(df2)
sScaler = StandardScaler(
    withMean=True, withStd=True, inputCol="temp_feature", outputCol="scaled"
)
sScaler.fit(tmpdf).transform(tmpdf).show()
#+----+----+----+------------+---------------------+
#|int1|int2|int3|temp_feature|scaled               |
#+----+----+----+------------+---------------------+
#|1.0 |2.0 |3.0 |[2.0]       |[-1.2247448713915892]|
#|4.0 |5.0 |6.0 |[5.0]       |[0.0]                |
#|7.0 |8.0 |9.0 |[8.0]       |[1.2247448713915892] |
#|4.0 |5.0 |6.0 |[5.0]       |[0.0]                |
#+----+----+----+------------+---------------------+

Spark 中的 StandardScaler 未按预期工作

StandardScaler in Spark not working as expected

apache-spark

pyspark

apache-spark-ml