ODE 中的时间相关事件

Time-dependent events in ODE

我最近开始使用 Julia 并想实现我经常遇到的问题之一 - 实现时间相关的事件。

现在我有:

# Packages
using Plots
using DifferentialEquations

# Parameters
k21 = 0.14*24
k12 = 0.06*24
ke = 1.14*24
α = 0.5
β = 0.05
η = 0.477
μ = 0.218
k1 = 0.5
V1 = 6

# Time
maxtime = 10
tspan = (0.0, maxtime)

# Dose
stim = 100

# Initial conditions
x0 = [0 0 2e11 8e11]

# Model equations
function system(dy, y, p, t)
  dy[1] = k21*y[2] - (k12 + ke)*y[1]
  dy[2] = k12*y[1] - k21*y[2]
  dy[3] = (α - μ - η)*y[3] + β*y[4] - k1/V1*y[1]*y[3]
  dy[4] = μ*y[3] - β*y[4]
end

# Events
eventtimes = [2, 5]
function condition(y, t, integrator)
    t - eventtimes
end
function affect!(integrator)
    x0[1] = stim
end
cb = ContinuousCallback(condition, affect!)

# Solve
prob = ODEProblem(system, x0, tspan)
sol = solve(prob, Rodas4(), callback = cb)

# Plotting
plot(sol, layout = (2, 2))

但是给出的输出不正确。更具体地说,事件没有被考虑在内,初始条件似乎不是 0 for y1 而是 stim.

如有任何帮助,我们将不胜感激。

t - eventtimes 不起作用,因为一个是标量,另一个是矢量。但是对于这种情况,只使用 DiscreteCallback 会容易得多。当您将其设置为 DiscreteCallback 时,您应该预先设置停止时间,以便它点击 25 进行回调。这是一个例子:

# Packages
using Plots
using DifferentialEquations

# Parameters
k21 = 0.14*24
k12 = 0.06*24
ke = 1.14*24
α = 0.5
β = 0.05
η = 0.477
μ = 0.218
k1 = 0.5
V1 = 6

# Time
maxtime = 10
tspan = (0.0, maxtime)

# Dose
stim = 100

# Initial conditions
x0 = [0 0 2e11 8e11]

# Model equations
function system(dy, y, p, t)
  dy[1] = k21*y[2] - (k12 + ke)*y[1]
  dy[2] = k12*y[1] - k21*y[2]
  dy[3] = (α - μ - η)*y[3] + β*y[4] - k1/V1*y[1]*y[3]
  dy[4] = μ*y[3] - β*y[4]
end

# Events
eventtimes = [2.0, 5.0]
function condition(y, t, integrator)
    t ∈ eventtimes
end
function affect!(integrator)
    integrator.u[1] = stim
end
cb = DiscreteCallback(condition, affect!)

# Solve
prob = ODEProblem(system, x0, tspan)
sol = solve(prob, Rodas4(), callback = cb, tstops = eventtimes)

# Plotting
plot(sol, layout = (2, 2))

这完全避免了寻根,因此它应该是一个更好的解决方案,可以将时间选择写入寻根系统。

无论如何,请注意 affect 已更改为

function affect!(integrator)
    integrator.u[1] = stim
end

它需要修改当前的 u 值,否则它不会做任何事情。