为多个会话保留 XPtr

Question

我有一个 R 函数，它创建一个 Primebase Cpp Class 然后 returns 一个 XPtr<Primebase> 指针。

由于构建过程需要大量时间，我想将 Primebase 的实例保存到我的会话中，以便下次打开 R 我可以直接访问 Primebase实例。

不幸的是，一旦我关闭 R 并且 XPtr 变成 null pointer。

，底层对象就会被删除

有没有办法阻止 R 删除对象或任何其他方式来保存底层对象？

Answer 1

由 Rcpp::Xptr 管理的 C++ 对象在 R 会话结束时被销毁。如果要保存对象，则必须将其序列化。 Rcereal 包提供了一种不错的可能性。下面的例子使用一个简单的 Primebase class 和一个构造函数中的人工睡眠来模拟构造过程中的繁重处理。检查对象的内容后，将其序列化并销毁。之后对象被反序列化并再次包装到 Xptr 中。请注意，反序列化比构造便宜得多：

#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::plugins("cpp11")]]
// [[Rcpp::depends(Rcereal)]]
#include <cereal/archives/binary.hpp>
#include <chrono>
#include <fstream>
#include <thread>

class Primebase
{
private:
  int x;

public:
  Primebase() : x{0} {};
  Primebase(int x_) : x{x_} {std::this_thread::sleep_for(std::chrono::seconds(1));};

  int answer() {return x;}

  template <class Archive>
  void serialize(Archive & ar)
  {
    ar(x);
  }
};

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> create(int x) {
  Primebase* instance = new Primebase(x);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


// [[Rcpp::export]]
int answer(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr) {
  return xptr.get()->answer();
}

// [[Rcpp::export]]
void mySerialize(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr, std::string filename) {
  std::ofstream os(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryOutputArchive archive(os);
  archive(*xptr.get());
}

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> myDeserialize(std::string filename) {
  std::ifstream is(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryInputArchive archive(is);
  Primebase* instance = new Primebase;
  archive(*instance);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


/*** R
system.time(xptr <- create(42))
answer(xptr)
mySerialize(xptr, "test.cereal")
rm(xptr)
exists("xptr")
system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
answer(xptr)
*/

输出：

> system.time(xptr <- create(42))
   user  system elapsed 
  0.000   0.000   1.001 

> answer(xptr)
[1] 42

> mySerialize(xptr, "test.cereal")

> rm(xptr)

> exists("xptr")
[1] FALSE

> system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
   user  system elapsed 
      0       0       0 

> answer(xptr)
[1] 42

参考文献：

为多个会话保留 XPtr

Keep XPtr for multiple sessions

c++

r

rcpp