可视化 NbClust 的结果

Question

在对我的数据执行 NbClust 后，我发现根据多数规则，5 个聚类被确定为最佳数量。但是，我如何找出哪些指数产生了这 5 个集群？

另外，如何使用省略号绘制这些新数据和 color/group？过去我使用过 facto 包中的 fviz_cluster，但通常使用 kmeans 对象。我试图输入我的 nb 但这是一个列表，因此导致错误。我知道我可以绘制具有最佳簇数的直方图，但我并没有尝试绘制它。

以虹膜为例的可重现示例

library("NbClust")
data(iris)
iris.scaled <- scale(iris[, -5])
set.seed(123)
res.nb <- NbClust(iris.scaled, distance = "euclidean",
                  min.nc = 2, max.nc = 10, 
                  method = "complete", index ="gap") 
res.nb # print the results
fviz_nbclust(res.nb) + theme_minimal()

Answer 1

参数 index 应该是 all。但是，可以通过忽略填写此参数让包本身执行此操作。

res.nb <- NbClust(iris.scaled, distance = "euclidean",
                  min.nc = 2, max.nc = 10, 
                  method = "complete")

res.nb <- NbClust(iris.scaled, distance = "euclidean",
                  min.nc = 2, max.nc = 10, 
                  method = "complete", 
                  index ="all")

library(factoextra)
fviz_nbclust(res.nb)

可视化 NbClust 的结果

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r

cluster-analysis