使用指数减法评估 symfit 模型时的 AttributeError
AttributeError when evaluating symfit model with substraction in exponent
我已经建立了一个模型来拟合一些指数减法的数据。它适合拟合,但是当我明确评估模型时,我得到了奇怪的结果和一个 AttributeError: 'Mul' object has no attribute 'exp'.
问题似乎源于 lambdify 的工作方式,并在评估包含重要函数(例如增强或指数)的模型时发生。
import symfit as sf
a = sf.Parameter('a',1,0,2) #name, initial value, minimum, maximum
b = sf.Parameter('b',1,0,2)
c=sf.Parameter('c',1,0,2)
x, y = sf.variables('x, y')
model=sf.Model({y: a * (c - sf.exp((x) / b))})
model(1,a,b,c)
Out: Ans(y=a*(c + 1))
model=sf.Model({y: a * (1 - sf.exp((x-c) / b))})
model(1,a,b,c)
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-9-faba3b52b923>", line 1, in <module>
model(1,a,b,c)
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 334, in __call__
return Ans(*self.eval_components(**bound_arguments.arguments))
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 296, in eval_components
return [expr(*args, **kwargs) for expr in self.numerical_components]
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 296, in <listcomp>
return [expr(*args, **kwargs) for expr in self.numerical_components]
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\sympy\utilities\lambdify.py", line 444, in wrapper
return funcarg(*newargs, **kwargsx)
File "<string>", line 1, in <lambda>
AttributeError: 'Mul' object has no attribute 'exp'
我希望使用参数的初始值或得到一个象征性的答案,但两者都得不到。
因此,对于第一个模型,结果既错误又不一致,我希望
Ans(y=a*(c-exp(1/b))
或
Ans(y=a*(c-1))
或者只是简单地
Ans(y=0)
对于第二个模型,lambdify 似乎无法解析表达式。
使用sf.sqrt() 或sympy.exp() 时也是如此。
我在 python 3.6.7 和 IPython 7.1.1 中工作,使用 Symfit 0.4.6 和 Sympy 1.1.1(因为 Symfit 不适用于根据 pip 的更高版本)。
我可以使用任一模型来拟合数据,并使用此处示例中所示的最佳拟合参数评估模型 (https://pypi.org/project/symfit/)。该行
yfit = model(x=xdata, **fit_result.params)[y]
也不起作用(在 python 2.7、3.5 和 3.6 上试过)除非更改为
yfit = [model(x=x, **fit_result.params) for x in xdata]
在 symfit
中调用 Model
意味着符号表达式被转换为 lambda 函数,即不再是符号的普通 python 函数。
在您的示例中,调用
sf.Model({y: a * (c - sf.exp((x) / b))})
相当于写作
lambda x, a, b, c: a * (c - np.exp((x) / b))
请注意,符号指数现已更改为 numpy
。从这个例子可以看出模型不是用符号表达式调用的,而是用数字或数组调用的。
所以你的电话应该改为
model(x=1, a=1, b=1, c=1)
如果您需要在符号级别上工作,请继续直接使用 Model
中的表达式,该调用纯粹用于数值用途。
最后,文档中的示例假设 xdata 是一个数组,但在示例中它是一个列表。那应该(由我)更新。
最后一点,学会喜欢 python 中的关键字参数;)。以下是等价的:
a = sf.Parameter('a',1,0,2) #name, initial value, minimum, maximum
a = sf.Parameter('a', value=1, min=0, max=2)
但只有一个是自我记录的:)。
我已经建立了一个模型来拟合一些指数减法的数据。它适合拟合,但是当我明确评估模型时,我得到了奇怪的结果和一个 AttributeError: 'Mul' object has no attribute 'exp'.
问题似乎源于 lambdify 的工作方式,并在评估包含重要函数(例如增强或指数)的模型时发生。
import symfit as sf
a = sf.Parameter('a',1,0,2) #name, initial value, minimum, maximum
b = sf.Parameter('b',1,0,2)
c=sf.Parameter('c',1,0,2)
x, y = sf.variables('x, y')
model=sf.Model({y: a * (c - sf.exp((x) / b))})
model(1,a,b,c)
Out: Ans(y=a*(c + 1))
model=sf.Model({y: a * (1 - sf.exp((x-c) / b))})
model(1,a,b,c)
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-9-faba3b52b923>", line 1, in <module>
model(1,a,b,c)
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 334, in __call__
return Ans(*self.eval_components(**bound_arguments.arguments))
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 296, in eval_components
return [expr(*args, **kwargs) for expr in self.numerical_components]
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\symfit\core\fit.py", line 296, in <listcomp>
return [expr(*args, **kwargs) for expr in self.numerical_components]
File "C:\PortablePrograms\Python\WPy-3670\python-3.6.7.amd64\lib\site-packages\sympy\utilities\lambdify.py", line 444, in wrapper
return funcarg(*newargs, **kwargsx)
File "<string>", line 1, in <lambda>
AttributeError: 'Mul' object has no attribute 'exp'
我希望使用参数的初始值或得到一个象征性的答案,但两者都得不到。
因此,对于第一个模型,结果既错误又不一致,我希望
Ans(y=a*(c-exp(1/b))
或
Ans(y=a*(c-1))
或者只是简单地
Ans(y=0)
对于第二个模型,lambdify 似乎无法解析表达式。
使用sf.sqrt() 或sympy.exp() 时也是如此。 我在 python 3.6.7 和 IPython 7.1.1 中工作,使用 Symfit 0.4.6 和 Sympy 1.1.1(因为 Symfit 不适用于根据 pip 的更高版本)。
我可以使用任一模型来拟合数据,并使用此处示例中所示的最佳拟合参数评估模型 (https://pypi.org/project/symfit/)。该行
yfit = model(x=xdata, **fit_result.params)[y]
也不起作用(在 python 2.7、3.5 和 3.6 上试过)除非更改为
yfit = [model(x=x, **fit_result.params) for x in xdata]
在 symfit
中调用 Model
意味着符号表达式被转换为 lambda 函数,即不再是符号的普通 python 函数。
在您的示例中,调用
sf.Model({y: a * (c - sf.exp((x) / b))})
相当于写作
lambda x, a, b, c: a * (c - np.exp((x) / b))
请注意,符号指数现已更改为 numpy
。从这个例子可以看出模型不是用符号表达式调用的,而是用数字或数组调用的。
所以你的电话应该改为
model(x=1, a=1, b=1, c=1)
如果您需要在符号级别上工作,请继续直接使用 Model
中的表达式,该调用纯粹用于数值用途。
最后,文档中的示例假设 xdata 是一个数组,但在示例中它是一个列表。那应该(由我)更新。
最后一点,学会喜欢 python 中的关键字参数;)。以下是等价的:
a = sf.Parameter('a',1,0,2) #name, initial value, minimum, maximum
a = sf.Parameter('a', value=1, min=0, max=2)
但只有一个是自我记录的:)。