Ipython bash/shell 细胞魔法:我可以在细胞之间使用持久变量吗?

Ipython bash/shell cell magics: can I have persistent variables between cells?

这是我第一次 post SO,所以如果我做错了什么请告诉我。

我有兴趣在 ipython 中使用不同的编程语言,类似于 babel/literal 在 emacs org 模式中编程。我喜欢 emacs org 模式的一点是,一个人可以有多个 "cells" 连接到同一个 R/bash 会话。这允许我重新使用在文档的较早部分创建的 variables/functions,即使我在两者之间做了其他事情。

我发现 ipython 使用 Rmagic 可以做到这一点。举个例子

In [1]: %load_ext rpy2.ipython

In [2]: %%R
        a <- 3
        a
Out [2]: 3

In [3]: something_in_python = 'I am doing something unrelated now'

In [4]: %%R
        cat('My variable a is still here, its value is: ', a) # a is still here!

Out [4]: My variable is still here, its value is: 3

我非常希望能够在 bash 中做类似的事情。但是,无论我使用“%%script bash”还是 %%sx,变量都不是持久的。这是我正在尝试做的事情:

In [1]: %%script bash
        var1="hello"
        echo $var1

Out[1]: hello

In [2]: %%script bash
        echo $var1 # I need $var1 to be present in this cell too - but its gone!

Out[62]: 

是否可以在多个单元格中进行相同的基本会话?或者至少以某种方式传递变量。当然,我可以尝试将变量传递到 python 然后返回到下一个 bash 单元格,但我觉得一定有更好的方法。感谢您的帮助!

PS:我在寻找解决方案,但在这里或通过谷歌搜索都没有找到任何东西。有一些像这样的东西:IPython Notebook previous cell content,但它似乎对我的情况没有帮助。

一个选项虽然有限,但允许设置 stdout 和 stderr 变量。这使您可以在单元格之间设置和传递两个变量。例如:

In [1]:%%bash --out var1 --err var2
       echo "Hello"
       echo "Hi" >&2

In [2]:print(var1)
       print(var2)
# Resulting in:
       Hello

       Hi

In [3]:%%bash -s "$var1" "$var2"
       echo "arg1 takes on var1 = "
       echo "arg2 takes on var2 = "
# Resulting in:
       arg1 takes on var1 = Hello

       arg2 takes on var2 = Hi

请注意,eol 字符似乎进入了变量。

有关使用 stdout 和 stderr 的详细信息,请参阅 http://nbviewer.ipython.org/github/ipython/ipython/blob/master/examples/IPython%20Kernel/Script%20Magics.ipynb

有关将变量传回的详细信息,请参阅 Can I access python variables within a `%%bash` or `%%script` ipython notebook cell?