InconsistentTableError rows different from columns error of astropy Table.read()
InconsistentTableError rows different from columns error of astropy Table.read()
我正在尝试读取带有 astropy 的 Table.read() 的 .txt 文件：
data = Table.read('BD_FONDECYT_1120715Py(03-2019).txt', format='ascii', guess=False)
我添加了 guess=False，因为没有它，错误就不太清楚了。
我正在使用数据库，并且总是使用脚本来读取它。现在，我添加了一些新数据，代码显示了这个错误：
'Traceback (most recent call last):
data = Table.read('BD_FONDECYT_1120715Py(03-2019).txt', format='ascii', guess=False)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\table\table.py", line 2550, in read
out = io_registry.read(cls, *args, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\registry.py", line 517, in read
data = reader(*args, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\connect.py", line 20, in read_asciitable
return read(filename, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\ui.py", line 390, in read
dat = fast_reader_rdr.read(table)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\fastbasic.py", line 128, in read
data, comments = self.engine.read(try_int, try_float, try_string)
File "astropy\io\ascii\cparser.pyx", line 385, in astropy.io.ascii.cparser.CParser.read astropy.io.ascii.core.InconsistentTableError: Number of header columns (22) inconsistent with data columns in data line 0'
我查看了所有地方，更改了 table 上的每个值（浮点数和小数点后两位），检查了新值是否有空白 space 或类似的东西，但是不能'不知道发生了什么。我什至将 Python 版本从 2.7 更改为 3.7，并重新安装了 astropy 和 numpy。
如何解决这个问题？
出现此问题是因为您的数据 table 的列数不同，可能是因为缺少数据值。 AstroPy 尝试猜测 header 和 table 的数据部分（您可以在调用 astropy.io.ascii.read() 时用 header_start= 和 data_start= 覆盖，请参阅method definition 在文档中）。 header 用于定义它期望从 table 中读取的列数；如果这在您的数据中途发生变化，您将获得 InconsistentTableError
例如，如果您有一个如下所示的 table（使用散列作为 comment/header 分隔符）：
# X Y Z
1 2 3
3 4 5
6 9
那么它会在第 3 行失败，因为现在有 2 列而不是 3 列。您需要确保生成 table 的任何内容都会为 bad/missing 数据 [=26] 填写 'something' =] 这不能被误认为是列之间的分隔符（或在调用中覆盖它）。这可能就是为什么它在转换为 CSV 后 "appeared to work"； CSV 区分了原始 table 数据中可能不存在的常见空白值（空格）和列分隔符（逗号），从而防止了缺失值和列之间的间隙之间的代码混淆。
我正在尝试读取带有 astropy 的 Table.read() 的 .txt 文件：
data = Table.read('BD_FONDECYT_1120715Py(03-2019).txt', format='ascii', guess=False)
我添加了 guess=False，因为没有它，错误就不太清楚了。
我正在使用数据库，并且总是使用脚本来读取它。现在，我添加了一些新数据，代码显示了这个错误：
'Traceback (most recent call last):
data = Table.read('BD_FONDECYT_1120715Py(03-2019).txt', format='ascii', guess=False)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\table\table.py", line 2550, in read
out = io_registry.read(cls, *args, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\registry.py", line 517, in read
data = reader(*args, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\connect.py", line 20, in read_asciitable
return read(filename, **kwargs)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\ui.py", line 390, in read
dat = fast_reader_rdr.read(table)
File "C:\Python3\lib\site-packages\astropy\io\ascii\fastbasic.py", line 128, in read
data, comments = self.engine.read(try_int, try_float, try_string)
File "astropy\io\ascii\cparser.pyx", line 385, in astropy.io.ascii.cparser.CParser.read astropy.io.ascii.core.InconsistentTableError: Number of header columns (22) inconsistent with data columns in data line 0'
我查看了所有地方，更改了 table 上的每个值（浮点数和小数点后两位），检查了新值是否有空白 space 或类似的东西，但是不能'不知道发生了什么。我什至将 Python 版本从 2.7 更改为 3.7，并重新安装了 astropy 和 numpy。
如何解决这个问题？
出现此问题是因为您的数据 table 的列数不同，可能是因为缺少数据值。 AstroPy 尝试猜测 header 和 table 的数据部分（您可以在调用 astropy.io.ascii.read() 时用 header_start= 和 data_start= 覆盖，请参阅method definition 在文档中）。 header 用于定义它期望从 table 中读取的列数；如果这在您的数据中途发生变化，您将获得 InconsistentTableError
例如，如果您有一个如下所示的 table（使用散列作为 comment/header 分隔符）：
# X Y Z
1 2 3
3 4 5
6 9
那么它会在第 3 行失败，因为现在有 2 列而不是 3 列。您需要确保生成 table 的任何内容都会为 bad/missing 数据 [=26] 填写 'something' =] 这不能被误认为是列之间的分隔符（或在调用中覆盖它）。这可能就是为什么它在转换为 CSV 后 "appeared to work"； CSV 区分了原始 table 数据中可能不存在的常见空白值（空格）和列分隔符（逗号），从而防止了缺失值和列之间的间隙之间的代码混淆。