Dockerfile 找不到可执行脚本(没有那个文件或目录)

Dockerfile cannot find executable script (no such file or directory)

我正在编写 Dockerfile 以便为 Web 服务器(更准确地说是闪亮的服务器)创建映像。它运行良好,但它依赖于一个巨大的数据库文件夹 (db/),它没有随包一起分发,所以我想在创建图像时通过 运行ning 相应的Dockerfile 中的脚本。

我原以为这很简单,但我很难弄清楚我的文件在图像中的位置

这个 repo 具有以下结构:

Dockerfile
preprocessing_files
configuration_files
app/
    application_files
    db/
        processed_files

因此 app/db/ 不存在,但在 preprocessing_files 为 运行 时创建并填充文件。

Dockerfile 如下:

# Install R version 3.6
FROM r-base:3.6.0

# Install Ubuntu packages
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    sudo \
    gdebi-core \
    pandoc \
    pandoc-citeproc \
    libcurl4-gnutls-dev \
    libcairo2-dev/unstable \
    libxml2-dev \
    libxt-dev \
    libssl-dev

# Download and install ShinyServer (latest version)
RUN wget --no-verbose https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/VERSION -O "version.txt" && \
    VERSION=$(cat version.txt)  && \
    wget --no-verbose "https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-$VERSION-amd64.deb" -O ss-latest.deb && \
    gdebi -n ss-latest.deb && \
    rm -f version.txt ss-latest.deb

# Install R packages that are required
RUN R -e "install.packages(c('shiny', 'flexdashboard','rmarkdown','tidyverse','plotly','DT','drc','gridExtra','fitdistrplus'), repos='http://cran.rstudio.com/')"

# Copy configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.conf /etc/shiny-server/shiny-server.conf
COPY /app /srv/shiny-server/
COPY /app/db /srv/shiny-server/app/

# Make the ShinyApp available at port 80
EXPOSE 80

CMD ["/usr/bin/shiny-server"]

这个上面的文件很好用如果preprocessing_files提前运行,所以app/application_files可以成功读取app/db/processed_files。这个脚本在 Dockerfile 中怎么会是 运行 呢?对我来说,直观的解决方案就是简单地写:

RUN bash -c "preprocessing.sh"

ADD指令之前,但在preprocessing_files指令之前没有找到。如果上面的指令写在ADD下面,也写在WORKDIR app/下面,也会出现同样的错误。我不明白为什么。

您无法从 Dockerfile 在主机上执行代码。 RUN 命令在正在构建的容器内执行。您可以:

  • 在 docker 容器内复制 preprocessing_files 并在容器内复制 运行 preprocessing.sh(这会增加容器的大小)
  • 创建一个 makefile/build.sh 脚本,在执行 docker build
  • 之前启动 preprocessing.sh