从 R 中的生存对象中提取生存时间向量
Extract the survival times vector from survival object in R
我想从 R 中的生存对象中提取具有生存时间的向量。
样本数据(从指数模型模拟):
library(survival)
set.seed(123)
x <- Surv(rexp(100, rate = 0.001))
其结构如下:
str(x)
Surv [1:100, 1:2] 843.5 576.6 1329.1 31.6 56.2 316.5 314.2 145.3 2726.2 29.2 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : NULL
..$ : chr [1:2] "time" "status"
- attr(*, "type")= chr "right"
问题
如何提取仅包含生存时间的向量?我尝试了 unlist()
和 unname()
函数,但没有成功。
预期输出
> vector_survival_times
[1] 843.5 576.6 1329.1 31.6 56.2 316.5 314.2 145.3 2726.2 29.2 ...
你需要先用survfit()
拟合模型:
library(survival)
set.seed(123)
su = Surv(rexp(100, rate = 0.001))
model = survfit(su~1)
model$surv
要从生存对象中提取数据(Surv()
函数),您可以使用子集:
library(survival)
set.seed(123)
x <- Surv(rexp(100, rate = 0.001))
# Subsetting
x[,1]
我想从 R 中的生存对象中提取具有生存时间的向量。
样本数据(从指数模型模拟):
library(survival)
set.seed(123)
x <- Surv(rexp(100, rate = 0.001))
其结构如下:
str(x)
Surv [1:100, 1:2] 843.5 576.6 1329.1 31.6 56.2 316.5 314.2 145.3 2726.2 29.2 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : NULL
..$ : chr [1:2] "time" "status"
- attr(*, "type")= chr "right"
问题
如何提取仅包含生存时间的向量?我尝试了 unlist()
和 unname()
函数,但没有成功。
预期输出
> vector_survival_times
[1] 843.5 576.6 1329.1 31.6 56.2 316.5 314.2 145.3 2726.2 29.2 ...
你需要先用survfit()
拟合模型:
library(survival)
set.seed(123)
su = Surv(rexp(100, rate = 0.001))
model = survfit(su~1)
model$surv
要从生存对象中提取数据(Surv()
函数),您可以使用子集:
library(survival)
set.seed(123)
x <- Surv(rexp(100, rate = 0.001))
# Subsetting
x[,1]