难以在 HDF5 Table 数据中获取多列

Question

我是 hdf5 的新手，正在尝试将 DataFrame 行存储为 hdf5 格式。我要在文件的不同位置追加一行；但是，每次我附加它时，它都会显示在单列中的数组中，而不是多列中的单个值。

我已经尝试了 h5py 和 pandas，似乎 pandas 是更好的追加选项。此外，我真的一直在尝试很多不同的方法。真的，任何帮助将不胜感激。

这里是我将一个数组多次发送到 hdf5 文件中。


import pandas as pd
import numpy as np
data = np.zeros((1,48), dtype = float)

columnName = ['Hello'+str(y) for (x,y), item in np.ndenumerate(data)]
df = pd.DataFrame(data = data, columns =columnName)

file = pd.HDFStore('file.hdf5', mode = 'a', complevel = 9, comlib = 'blosc')
for x in range(0,11):
    file.put('/data', df, column_data = columnName , append = True, format = 'table')

Answer 1

In [243]: store = pd.HDFStore('test.h5')

这似乎工作正常：

In [247]: store.put('foo',df,append=True,format='table')                               
In [248]: store.put('foo',df,append=True,format='table')                               
In [249]: store.put('foo',df,append=True,format='table')                               
In [250]: store['foo']                                                                 
Out[250]: 
   Hello0  Hello1  Hello2  Hello3  Hello4  ...  Hello43  Hello44  Hello45  Hello46  Hello47
0     0.0     0.0     0.0     0.0     0.0  ...      0.0      0.0      0.0      0.0      0.0
0     0.0     0.0     0.0     0.0     0.0  ...      0.0      0.0      0.0      0.0      0.0
0     0.0     0.0     0.0     0.0     0.0  ...      0.0      0.0      0.0      0.0      0.0

[3 rows x 48 columns]

难以在 HDF5 Table 数据中获取多列

Having difficulty getting multiple columns in HDF5 Table Data

python

numpy

hdf5

pandas