R:如何在没有替换且没有连续相同值的情况下进行采样

R: how to sample without replacement AND without consecutive same values

我花了一天多的时间试图完成一件看起来很简单的事情。我必须创建 300 'random' 个序列,其中数字 1、2、3 和 4 都恰好出现 12 次,但同一个数字从未连续使用两次 'in a row'/

我最好的尝试(我猜)是:

  1. 用R抽取48个项目不放回,用rle测试是否有连续值,然后只使用不包含连续值的序列。问题:几乎没有满足这个条件的随机序列,所以需要很长时间。

  2. 让 R 创建没有连续值的序列(见代码)。

pop<-rep(1:4,12)
y=c()
while(length(y)!=48)
  {
  y= c(y,sample(pop,48-length(y),replace=F))
  y=y[!c(FALSE, diff(y) == 0)]
  }

问题:这会创建每个值的数量不同的序列。然后我尝试只使用那些每个值恰好有 12 个的序列,但这只会让我回到问题 1:需要永远。

一定有一些简单的方法可以做到这一点,对吧?非常感谢任何帮助!

也许使用 replicate()repeat 循环会更快。这里有一个 3 序列的例子。看起来这需要大约。 300 1490 秒(未测试)。

set.seed(42)
seqc <- rep(1:4, each=12)  # starting sequence

system.time(
  res <- replicate(3, {
    repeat {
      seqcs <- sample(seqc, 48, replace=FALSE) 
      if (!any(diff(seqcs) == 0)) break
    }
    seqcs
  })
)
#  user  system elapsed 
# 14.88    0.00   14.90 

res[1:10, ]
#       [,1] [,2] [,3]
#  [1,]    4    2    3
#  [2,]    1    1    4
#  [3,]    3    2    1
#  [4,]    1    1    4
#  [5,]    2    3    1
#  [6,]    4    1    2
#  [7,]    3    4    4
#  [8,]    2    1    1
#  [9,]    3    4    4
# [10,]    4    3    2

您可以取出连续的值并将它们放在不连续的地方。

unConsecutive  <- function(x) {
    repeat{
        tt <- c(FALSE, diff(x)==0)
        if(any(tt)) {
            y <- x[which(tt)]
            x <- x[which(!tt)]
            i <- x != y[1]
            i  <- which(c(c(TRUE, diff(i)==0) & i,FALSE)
                        | c(FALSE, c(diff(i)==0, TRUE) & i))
            if(length(i) > 0) {
                i <- i[1]-1
                x <- c(x[seq_len(i)], y, x[i+seq_len(length(x)-i)])
            } else {
                x  <- c(x, y)
                break
            }
        } else {break}
    }
    x
}

unConsecutive(c(1,1,2))
#[1] 1 2 1
unConsecutive(c(1,1,1))
#[1] 1 1 1

set.seed(7)
system.time(
    res <- replicate(300, unConsecutive(sample(rep(1:4,12))))
)
#   user  system elapsed 
#  0.058   0.011   0.069 
all(apply(res, 2, table) == 12)
#[1] TRUE
all(apply(res, 2, diff) != 0)
#[1] TRUE

另一种选择是使用马尔可夫链蒙特卡洛方法随机交换 2 个数字,仅当 1) 我们不交换相同数字和 2) 没有 2 个相同数字相邻时才移动到新样本。为了处理相关样本,我们可以生成大量样本,然后随机生成 select 300 个:

v <- rep(1:4, 12)
l <- 48
nr <- 3e5
m <- matrix(0, nrow=nr, ncol=l)
count <- 0
while(count < nr) {
    i <- sample(l, 2)
    if (i[1L] != i[2L]) {
        v[i] = v[i[2:1]]
        if (!any(diff(v)==0)) {
            count <- count + 1
            m[count, ] <- v
        } else {
            v[i] = v[i[2:1]]
        }
    }
}
a <- m[sample(nr, 300),]
a