在 ggplot2 中绘制线图时出错，我认为它以某种方式没有正确分组我的组

Question

我只是想用两个条件制作一个简单的线图：标准和偏差。

csv 中的数据最初看起来像这样：

是的，时间应该是负数。时间在这里是一个变量，从 -100 毫秒（事件发生前 100 毫秒）到 1500 毫秒（事件发生后 1500 毫秒）。本质上，我想做的是绘制标准条件和异常条件下的值（我稍后将其称为振幅）如何随时间变化。看起来像这样的东西：

不幸的是，我得到的是：

这是我的代码：

# Libraries
library(ggplot2)

# Plotting
ggplot(data=PupilERP, aes(x=Pt, y=Amplitude, group=Condition)) +
  geom_line() + scale_y_continuous(breaks = seq(-5,15,1)) + scale_x_continuous(breaks = seq(-100,1500,100))

编辑：正如评论中所要求的，这是我通过第 8 行后的示例数据- 出现在该行之后 colnames(PupilERP) <- c("Pt","Deviant","Standard")

另外，还有人要了dput输出。此时 Tt 太长了，无法为您提供数据（在 colnames 行之后），甚至最多只有 20 个点，所以在我完成所有重塑之后，这里是实际的 dput 输出。

structure(list(Pt = c(13L, 110L, 109L, 108L, 107L, 106L, 105L, 
104L, 103L, 102L, 101L, 99L, 98L, 97L, 96L, 95L, 94L, 93L, 92L, 
91L), Condition = c("Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", 
"Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", 
"Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant", 
"Deviant", "Deviant", "Deviant", "Deviant"), Amplitude = c(0.0089, 
-0.0066, -0.0076, 0.0105, 0.0514, 0.111, 0.178, 0.2396, 0.2851, 
0.306, 0.2999, 0.2708, 0.2277, 0.1796, 0.1318, 0.085, 0.0399, 
0.0012, -0.0264, -0.0413)), row.names = c(NA, 20L), class = "data.frame")

Answer 1

问题可能出现在您的数据处理中。您对 Pt 列的 as.integer 调用创建了错误的数字。这是因为在您对其进行转置之后，Pt 变量已成为一个因素，因此例如“-11”被解释为 15 级的因素（例如） - 这可能在您的数据中导致重复点（您会注意到图表中没有负数）。

要解决此问题，请在调用 as.integer 之前将 Pt 强制转换为字符向量。我使用虚拟数据执行以下操作（您的问题无法从上面的 dput 部分重现）：

library(ggplot2)
library(tidyr)

# dummy data
df <- read.csv("test.csv")

df <- t(df)
df <- as.data.frame(df)
df <- df[-1,]
colnames(df) <- c("Pt","Deviant","Standard")
df$Pt <- as.integer(as.character(df$Pt))  # the key change - will read neg. numbers
df <- gather(df, Condition, Amplitude, Deviant:Standard)
df$Amplitude <- as.numeric(df$Amplitude)

ggplot(df, aes(Pt, Amplitude, colour = Condition)) + geom_line()

希望能帮助解决一些问题。

在 ggplot2 中绘制线图时出错，我认为它以某种方式没有正确分组我的组

Error in plotting line plot in ggplot2, I think it somehow is not grouping my groups properly

r

ggplot2

line-plot