NumPy - 故障向量化方法

NumPy - Trouble vectorizing method

我有三个数组,abc。形状分别为(N, 2)(N, 3)(N, 3)

我需要比较 b 中每行的元素并更新 a 中同一行中的索引。我以为我已经了解如何矢量化此方法,但我认为我的尺寸不正确。

我目前拥有的是:

def to_cube(points):
    cube = np.empty((len(points), 3), dtype=np.half)
    delta = np.empty_like(cube)

    q = ((2 / 3) * points[:, 0]) / 0.1
    r = (((-1 / 3) * points[:, 0]) + ((np.sqrt(3) / 3) * points[:, 1])) / 0.1

    cube[:, 0] = np.round(q)
    cube[:, 1] = np.round(-q-r)
    cube[:, 2] = np.round(r)
    delta[:, 0] = np.abs(cube[:, 0] - q)
    delta[:, 1] = np.abs(cube[:, 1] - (-q-r))
    delta[:, 2] = np.abs(cube[:, 2] - r)

    if delta[:, 0] > delta[:, 1] and delta[:, 1] > delta[:, 2]:
        cube[:, 0] = -cube[:, 1] - cube[:, 2]
    elif delta[:, 1] > delta[:, 2]:
        cube[:, 1] = -cube[:, 0] - cube[:, 2]
    else:
        cube[:, 2] = -cube[:, 0] - cube[:, 1]

    return cube

这会引发 ValueError: The truth value of an array with more than one element is ambiguous

查看条件后,很明显 delta[:, 0] > delta[:, 1] 的第一次检查将 return 形状为 (N, 1) 的数组。我如何更改它以针对 a 中的每一行,获取该行上的适当索引,然后根据条件更新 b 中的同一行以获得特定索引?

编辑:样本

此示例假定 qr 已完成。这些矩阵表示 cubedelta:

>>> cube
array([[275.0, -400.0, 124.0]], dtype=float16) # so this is a (1, 3) but could be (N, 3)
>>> cube[0]
array([275.0, -400.0, 124.0], dtype=float16)
>>> delta
array([[5., 10., 3.]], dtype=float16)
>>> delta[0]
array([5., 10., 3.], dtype=float16)

现在通过条件执行(值被子):

if 5.0 > 10.0 and 10.0 > 3.0:
    cube[0] = -(-400.0) - 124.0
elif 10.0 > 3.0:
    cube[1] = -(275.0) - 124.0
else:
    cube[2] = -(275.0) - (-400.0)

return cube # array([275.0, -(275.0) - 124.0, 124.0], dtype=float16)

这显示了每行发生的情况,现在我需要对所有行执行此操作。

编辑:潜在解决方案(是否矢量化?)

有一种方法可以确保使用 for-range:

独立访问行
def to_cube(points):
    cube = np.empty((len(points), 3), dtype=np.half)
    delta = np.empty_like(cube)

    q = ((2 / 3) * points[:, 0]) / 0.1
    r = (((-1 / 3) * points[:, 0]) + ((np.sqrt(3) / 3) * points[:, 1])) / 0.1

    cube[:, 0] = np.round(q)
    cube[:, 1] = np.round(-q-r)
    cube[:, 2] = np.round(r)
    delta[:, 0] = np.abs(cube[:, 0] - q)
    delta[:, 1] = np.abs(cube[:, 1] - (-q-r))
    delta[:, 2] = np.abs(cube[:, 2] - r)

    for i in range(len(cube)):
        if delta[i, 0] > delta[i, 1] and delta[i, 1] > delta[i, 2]:
            cube[i, 0] = -cube[i, 1] - cube[i, 2]
        elif delta[i, 1] > delta[i, 2]:
            cube[i, 1] = -cube[i, 0] - cube[i, 2]
        else:
            cube[i, 2] = -cube[i, 0] - cube[i, 1]

    return cube

但是,我现在"looping over"数组,似乎没有矢量化或广播。

任何感兴趣的人,这就是我解决问题的方法:

def to_cube(points):
    cube = np.empty((len(points), 3), dtype=np.half)
    delta = np.empty_like(cube)

    q = ((2 / 3) * points[:, 0]) / 0.1
    r = (((-1 / 3) * points[:, 0]) + ((np.sqrt(3) / 3) * points[:, 1])) / 0.1

    cube[:, 0] = np.round(q)
    cube[:, 1] = np.round(-q-r)
    cube[:, 2] = np.round(r)
    delta[:, 0] = np.abs(cube[:, 0] - q)
    delta[:, 1] = np.abs(cube[:, 1] - (-q-r))
    delta[:, 2] = np.abs(cube[:, 2] - r)
    
    # define boolean arrays for where conditions exist
    rxc = ((delta[:, 0] > delta[:, 1]) & (delta[:, 1] > delta[:, 2]))
    ryc = (delta[:, 1] > delta[:, 2])
    rzc = ~(rxc + ryc)

    # update just those indices by condition
    cube[rxc, 0] = -cube[rxc, 1] - cube[rxc, 2]
    cube[ryc, 1] = -cube[ryc, 0] - cube[ryc, 2]
    cube[rzc, 2] = -cube[rzc, 0] - cube[rzc, 1]

    return cube

如果有人看到改进优化的空间,我很想知道!

我系统上的基准测试:

import numpy as np
from timeit import timeit

u = np.random.uniform

points = np.array([[u(0, 50), u(0, 50)] for _ in range(37000000)], dtype=np.half)

p = 'from __main__ import points, to_cube; to_cube(points)'

timeit(p, number=1)

# output: 17.94858811999