编译为 PDF 时 bookdown 中可能存在错误。图像被边缘切割

Question

当我为 pdf 输出编译我的 Bookdown 书籍时，我得到的数字被左右边距切割。如果我自己用 ggsave() 生成它们，然后用 knitter::include_graphics() 添加它们，就不会发生这种情况。

    ---
    output:
      pdf_document: default
      html_document: default
    ---

    # Example
    ```{r example, message=FALSE}
    require(tidyverse)
    ggplot(data=iris, aes(x=Sepal.Length, y=Sepal.Width))+geom_point()
    ```

我执行`bookdown::render("index.Rmd", output_format=pdf_book(keep_tex=TRUE))

我将此图像作为输出（在 main_files/figure-latex 中）

这是一个错误还是只有我？我该如何解决？我不太喜欢 ggsave() + knitr::include_image() 的想法，但这是我目前唯一的解决方法。

关于我的系统的额外信息

> xfun::session_info('bookdown')
R version 3.6.2 (2019-12-12)
Platform: x86_64-suse-linux-gnu (64-bit)
Running under: openSUSE Leap 15.1, RStudio 1.2.5019

Locale:
  LC_CTYPE=es_ES.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=es_ES.UTF-8       
  LC_COLLATE=es_ES.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8    LC_MESSAGES=es_ES.UTF-8   
  LC_PAPER=es_ES.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
  LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

Package version:
  base64enc_0.1.3 bookdown_0.17   digest_0.6.18   evaluate_0.14   glue_1.3.1     
  graphics_3.6.2  grDevices_3.6.2 highr_0.3       htmltools_0.4.0 jsonlite_1.6   
  knitr_1.28      magrittr_1.5    markdown_1.1    methods_3.6.2   mime_0.8       
  Rcpp_1.0.3      rlang_0.4.4     rmarkdown_2.1   stats_3.6.2     stringi_1.2.4  
  stringr_1.4.0   tinytex_0.18    tools_3.6.2     utils_3.6.2     xfun_0.8       
  yaml_2.2.0

Answer 1

如果您查看帮助页面 ?rmarkdown::pdf_document 上的 fig_crop 参数，您会发现如果 pdfcrop 可用，图形文件将默认被裁剪。您可以通过以下方式关闭此功能：

output:
  pdf_document:
    fig_crop: false

编译为 PDF 时 bookdown 中可能存在错误。图像被边缘切割

Possible bug in bookdown when compiling to PDF. Images get cut by the margins

r

r-markdown

bookdown

关于我的系统的额外信息