中位数和箱线图 (R)

Question

我写信给你们的论坛是因为我没有找到解决我的问题的方法。我试图用图形表示我们（我和我的团队）收集的蚊子的中值捕捉时间 (MCT)（我目前正在实习，研究象牙海岸的疟疾）。 MCT 表示 50% 的疟疾病媒在人类身上被捕获的时间。例如，我们收集了这个样本：

Hour of collection / Mosquitoes number:
20H-21H = 1
21H-22H = 1 
22H-23H = 2 
23H-00H = 2 
00H-01H = 13 
01H-02H = 10 
02H-03H = 15 
03H-04H = 15 
04H-05H = 8 
05H-06H = 10 
06H-07H = 6

此处有效累计为83只蚊子。我假设这个蚊子系列的中位数是 83+1/2 = 42（而且我什至没有在 R 上找到这个数字），导致中位数捕捉时间为凌晨 2 点 (02)。

因此，我尝试使用不同参数的函数"boxplot"，但我无法得到我想要的表示。事实上，当我想要表示收集期间累积的有效数据时，我会为收集的每个小时设置一个框。并且在 R 中使用的时间是“20H-21H”= 20，“21H-22H”= 21 等

我找到了一篇文章 (Nicolas Moiroux, 2012)，其中介绍了中值捕捉时间和我想要的箱线图。我复制引用的箱线图的图像： Boxplot_Moiroux2012

在此先感谢您的帮助，希望我的语法没问题（我的主要语言是法语，我的母语是法语）。

亲切的问候，爱德华

PS ：关于我在这组数据中使用的代码，我在这里（"Eff" = 蚊子数量和 "Heure" = 收集时间）：

总和（效果）

as.factor(Heure)

tapply(Eff,Heure,median) tapply(Heure,Eff,median)

箱线图（效果，水平=T）

箱线图（Heure~Eff）箱线图（Eff~Heur））

（我的R技能不是很熟练...）

Answer 1

您需要使用一个技巧，因为您已经有了计数，而不是每次捕获的时间数据。

首先，将时间值转换为更连续的变量，然后生成包含所有时间值的向量，然后然后绘制箱线图（使用自定义轴）。

txt <- "20H-21H = 1
21H-22H = 1
22H-23H = 2
23H-00H = 2
00H-01H = 13
01H-02H = 10
02H-03H = 15
03H-04H = 15
04H-05H = 8
05H-06H = 10
06H-07H = 6"

dat <- read.table(text = txt, sep = "=",  h = F)
colnames(dat) <- c("collect_time", "nb_mosquito")

# make a continuous numerical proxy for time
dat$collect_time_num <- 1:nrow(dat)

# get values of proxy according to your data
tvals <- rep(dat$collect_time_num, dat$nb_mosquito)

# plot
boxplot(tvals, horizontal = T, xaxt = "n")
axis(1, labels = as.character(dat$collect_time), at = dat$collect_time_num)

输出以下图：

中位数和箱线图 (R)

Median and Boxplot (R)

r

median

boxplot