如何从 R 中的两个栅格计算 r2？

Question

我有两个栅格，我想查看两者之间的相关性，并获得 r2。

 TOTAL2
class      : RasterLayer 
dimensions : 2803, 5303, 14864309  (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent     : 60.85, 105.0417, 15.95833, 39.31667  (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs        : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
source     : memory
names      : layer 
values     : 0, 400  (min, max)

> lpjENLF$VegCX2X0.7
class      : RasterLayer 
dimensions : 2803, 5303, 14864309  (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent     : 60.85, 105.0417, 15.95833, 39.31667  (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs        : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
source     : memory
names      : VegCX2X0.7 
values     : 1.874989e-05, 350  (min, max)

如何计算这两个栅格之间的 r2 值？我试图将两个栅格转换为数据帧，但两个数据帧 return 都为 NA。然后我申请 na.rm=T 并尝试找到 r2 但两个栅格的数据帧长度变得不同。我尝试的第二个解决方案是堆叠两个栅格并应用此代码：

layerStats(rasterstack,'pearson')

然而我得到：

$`pearson correlation coefficient`
           VegCX2X0.7 layer
VegCX2X0.7         NA    NA
layer              NA    NA

$mean
VegCX2X0.7      layer 
        NA         NA

Answer 1

选项 1：您可以在 layerStats

中使用 na.rm

layerStats(rasterstack, 'pearson', na.rm=T)

选项 2：您可以先从栅格对象中提取值并应用内置函数 cor。使用此函数，您应该添加参数 use="complete.obs" to get it working withNA` values.

cor(values(TOTAL2), values(lpjENLF$VegCX2X0.7), use="complete.obs", method = 'pearson')

如何从 R 中的两个栅格计算 r2？

How to compute r2 from two rasters in R?

r

raster

geospatial