UnboundLocalError: local variable 'animal_signals' referenced before assignment

Question

我有一些 Cython 代码，如果变量等于列表中的值，那么另一个列表中的值将被复制到测试数组中。

    double [:] signals
    cdef int total_days=signals.shape[0]
    cdef size_t epoch=0
    cdef int total_animals
    cdef int n
    cdef double[:] animal_signals
    
    for animal in range(total_animals):
        individual_animal = uniq_instr[animal]
                    
        for element in range(total_days):
            if list(animal_ids[n]) == individual_animal:
                animal_signals.append(signals[n])

我收到一个错误：

UnboundLocalError: local variable 'animal_signals' referenced before assignment

我想有线

cdef double[:] animal_signals

意味着数组已分配。

更新

按照建议，我也尝试声明数组 animal_signals（并删除追加）：

cdef int total_days=signals.shape[0]
cdef size_t epoch=0
cdef int total_animals
cdef int n
cdef int count=0

    for animal in range(total_animals):
        count=0
        individual_animal = uniq_instr[animal]
            
        for element in range(total_days):
            if list(animal_ids[element]) == individual_animal:
                cdef double[:] animal_signals[count] = signals[n]
                count=count+1

但是当我编译代码时出现错误：

Error compiling Cython file:
------------------------------------------------------------
...

        for element in range(total_days):
            if list(animal_ids[element]) == individual_animal:
                cdef double[:] animal_signals[count] = signals[n]
                    ^
------------------------------------------------------------

project/temps.pyx:288:21: cdef statement not allowed here

我哪里错了？

Answer 1

的确，你的台词cdef double[:] animal_signals 将 animal_signals 声明为一个变量，但在使用它之前你永远不会给它赋值（在 Python 中赋值是用 = 运算符完成的）。

在 Cython 中，在定义变量时使用切片 ([:]) 表示法通常是为了获取其他对象的内存视图（参见 the reference documentation）。

例如：

some_1d_numpy_array = np.zeros((10,10)).reshape(-1)
cdef double[:] animal_signals = some_1d_numpy_array

如果你想创建一个 C 数组，你必须为它 allocate the memory（这里的大小为 number 个包含 double 的条目）：

cdef double *my_array = <double *> malloc(number * sizeof(double))

此外，关于您的原始代码，请注意，在这两种情况下，您都无法在此对象上使用 append 方法，因为它不是 Python list, 你将不得不通过他们的索引访问它的成员。

UnboundLocalError: local variable 'animal_signals' referenced before assignment

UnboundLocalError: local variable 'animal_signals' referenced before assignment

cython

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