为 seaborn 热图分配特定颜色

Question

我正在尝试使用 seaborn 制作热图，但无法更改特定值的颜色。假设，值 0 应该是白色，值 1 应该是灰色，然后使用 cmap 提供的调色板。

试图使用面具，但感到困惑。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
import pandas as pd

df = pd.read_csv('/home/test.csv', index_col=0)

fig, ax = plt.subplots()
sns.heatmap(df, cmap="Reds", vmin=0, vmax=15)
plt.show()

这是示例数据

TAG     A   B   C   D   E   F   G   H   I   J
TAG_1   1   0   0   5   0   7   1   1   0   10
TAG_2   0   1   0   6   0   6   0   0   0   7
TAG_3   0   1   0   2   0   4   0   0   1   4
TAG_4   0   0   0   3   1   3   0   0   0   10
TAG_5   1   0   1   5   0   2   1   1   0   11
TAG_6   0   0   0   0   0   0   0   0   0   12
TAG_7   0   1   0   0   1   0   0   0   0   0
TAG_8   0   0   0   1   0   0   1   0   1   0
TAG_9   0   0   1   0   0   0   0   0   0   0
TAG_10  0   0   0   0   0   0   0   0   0   0

Answer 1

df.set_index('TAG', inplace=True) 告诉 seaborn 标签应该用作标签，而不是数据。

'binary' 颜色图从较低值的白色平滑到最高值的深黑色。使用 vmin 和 vmax，将 vmin=0 和 vmax 设置为介于 1.5 和大约 5 之间的值，值 0 将是白色，1 将是任何所需类型的灰色。

要设置掩码，应将数据帧转换为二维 numpy 数组并为 float 类型。

import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
import pandas as pd
from io import StringIO

data_str = StringIO('''TAG     A   B   C   D   E   F   G   H   I   J
TAG_1   1   0   0   5   0   7   1   1   0   10
TAG_2   0   1   0   6   0   6   0   0   0   7
TAG_3   0   1   0   2   0   4   0   0   1   4
TAG_4   0   0   0   3   1   3   0   0   0   10
TAG_5   1   0   1   5   0   2   1   1   0   11
TAG_6   0   0   0   0   0   0   0   0   0   12
TAG_7   0   1   0   0   1   0   0   0   0   0
TAG_8   0   0   0   1   0   0   1   0   1   0
TAG_9   0   0   1   0   0   0   0   0   0   0
TAG_10  0   0   0   0   0   0   0   0   0   0''')

df = pd.read_csv(data_str, delim_whitespace=True)
df.set_index('TAG', inplace=True)
values = df.to_numpy(dtype=float)
ax = sns.heatmap(values, cmap='Reds', vmin=0, vmax=15, square=True)
sns.heatmap(values, xticklabels=df.columns, yticklabels=df.index,
            cmap=plt.get_cmap('binary'), vmin=0, vmax=2, mask=values > 1, cbar=False, ax=ax)
plt.show()

或者，可以创建自定义颜色图。这样颜色栏也会显示调整后的颜色。

from matplotlib.colors import LinearSegmentedColormap

cmap_reds = plt.get_cmap('Reds')
num_colors = 15
colors = ['white', 'grey'] + [cmap_reds(i / num_colors) for i in range(2, num_colors)]
cmap = LinearSegmentedColormap.from_list('', colors, num_colors)
ax = sns.heatmap(df, cmap=cmap, vmin=0, vmax=num_colors, square=True, cbar=False)
cbar = plt.colorbar(ax.collections[0], ticks=range(num_colors + 1))
plt.show()

为 seaborn 热图分配特定颜色

Assign specific color to seaborn heatmap

heatmap

seaborn