两组的 R 生存曲线看起来很奇怪

Question

我使用以下代码估计了两组的 Kaplan-Meier：

test3 <- survfit(Surv(wave, con3) ~ sex, data = consult3)
ggsurvplot(test3, color = "#2E9FDF",
       risk.table = TRUE, risk.table.y.text.col = TRUE)

尽管它产生了 KM，但它看起来很奇怪，并且没有向我显示 sex==1 或 sex==2 的 2 条不同的生存曲线。有人知道我可能做错了什么吗？谢谢！！

Answer 1

最好包含一些样本数据，这样我们就能知道问题出在哪里。但是，让我们看看是否可以创建一些数据来重现您的问题：

library(survival)
library(survminer)

set.seed(69)

consult3 <- data.frame(sex = rep(1:2, each = 50),
                       con3 = c(rbinom(50, 1, 0.2), rbinom(50, 1, 0.4)),
                       wave = sample(3, 100, TRUE))

现在，使用您的代码，我们可以获得 similar-looking 结果：

test3 <- survfit(Surv(wave, con3) ~ sex, data = consult3)

ggsurvplot(test3, risk.table = TRUE, color = "#2E9FDF",
           risk.table.y.text.col = TRUE)

据我所知，问题在于您设置了单一的颜色审美。解决方案是删除这个：

ggsurvplot(test3, risk.table = TRUE, risk.table.y.text.col = TRUE)

如果您想控制线条的颜色，请使用 palette 而不是 color:

ggsurvplot(test3, palette = c("red", "forestgreen"), alpha = 0.5,
           risk.table = TRUE, risk.table.y.text.col = TRUE)

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2020-09-19 创建

两组的 R 生存曲线看起来很奇怪

R Survival curve with two groups looks weird

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survival-analysis