在 Julia 中导出为 CSV 文件

Exporting to CSV files in Julia

警告:这些都是菜鸟问题,因为我真的 Julia 新手。

在 R 中,有一个非常“统一”的函数可以导出(几乎)任何类型的对象 read.table()。看起来 Julia 中的事情稍微复杂一些。如果我理解的很好:

  1. 某些标准类型(例如,数组、字典和元组)始终可以使用 writedlm 导出,但并非总是可以使用 CSV.write 导出。相反,DataFrames 总是可以用 CSV.write 导出,但不能用 writedlm 导出。这个对吗?因此,与 R 的 write.table()?

    类似,不存在“通用出口商”
  2. 除了写入 CSV 文件外,CSV.write 似乎还 return 导出文件的名称。相反,writedlm 则不会。这对我来说是个问题。实际上,我需要一种将 DataFrame 导出到 CSV 文件的方法,该文件具有 not return 值的功能,即仅具有副作用的功能,例如 writedlm。有什么办法可以在 Julia 中实现这一点?

    编辑:更详细地说,我的问题是在 CSV.write 之后,ans 指向导出文件的名称; writedlm 不是这种情况。插图 here and here。即使有@Przemyslaw Szufel 给出的想法,我也无法摆脱它。 (这是一个相当微妙的问题,但我实际上正在尝试为 Julia 编写一个 emacs lisp 后端。这种不一致,例如不知道 ans 是否会是 nothing 或导出后的文件名对象,在这次冒险中增加了一些痛苦......:-)理想情况下,我只是希望 CSV.write 可以保持沉默。)

谢谢!

我从第二个问题开始,因为它很短。只需在行尾使用分号 ; 并且不会返回任何值!

CSV.write(file, table);

但是,如果您想确保 ans 没有值,请在末尾添加 nothing

CSV.write(file, table);nothing;

如果你愿意,你可以把它打包成一个函数:

function my_write(file, table)
    CSV.write(file, table)
    nothing
end

或者,如果您想要 one-liner 将其包装到 lambda 中:

julia> (() -> begin;CSV.write("file.csv", df);nothing;end)()

julia> ans == nothing
true

在每种情况下都不会观察到副作用(返回值)。

第一个问题比较棘手。用于在文件中存储数据的可能格式显然需要取决于数据的格式。基本上,Julia 最常见的选项包括(我从最通用的选项开始,到最具体的选项结束):

  • 通过serialize命令序列化
  • 二进制 JSON 通过 BSON.jl
  • JSON 通过 JSON.jl 或稍新的 JSON3.jl 包(从今天开始都是不错的选择)
  • JSONTables.jl 对于存储为 JSON
  • 的表格数据
  • DelimitedFiles用于存储Arrays
  • CSV.jl用于存储DataFrames

现在,特定包的选择将取决于您的 objective。序列化是杀手级机制——速度最快,用途最广。任何对象都可以在尽可能短的时间内以这种方式存储。一切都是有代价的——当你更新 Julia 版本或你的包时,你可能无法读回你的对象。所以它是为短期存储而设计的。

桩子中间是 JSON-based 存储系统。基本上,所有内容都可以存储为 JSON,以后可以在 Julia 或其他编程语言中读取。基于文本的 JSON 也可以在简单的文本编辑器中打开。

最后,CSV.jlSerialization可以分别用于表格和数组。但是,很容易将 DataFrame 转换为 Array 或将 Array 转换为 DataFrame:

julia> df = DataFrame(a=1:3, b=rand(3),c=["a","b","c"])
3×3 DataFrame
│ Row │ a     │ b        │ c      │
│     │ Int64 │ Float64  │ String │
├─────┼───────┼──────────┼────────┤
│ 1   │ 1     │ 0.440796 │ a      │
│ 2   │ 2     │ 0.44232  │ b      │
│ 3   │ 3     │ 0.282064 │ c      │

julia> Matrix(df)
3×3 Array{Any,2}:
 1  0.440796  "a"
 2  0.44232   "b"
 3  0.282064  "c"

您可以看到,在此过程中唯一丢失的是类型信息,如果您通过 DelimitedFiles.

导出数据,这并不重要。

反过来的转换也很简单:

julia> rand(3,3) |> Tables.table |> DataFrame
3×3 DataFrame
│ Row │ Column1  │ Column2   │ Column3  │
│     │ Float64  │ Float64   │ Float64  │
├─────┼──────────┼───────────┼──────────┤
│ 1   │ 0.326649 │ 0.0278134 │ 0.111221 │
│ 2   │ 0.769378 │ 0.996156  │ 0.237821 │
│ 3   │ 0.802094 │ 0.726497  │ 0.619013 │

总之,如您所见,一切都可以在 Julia 中完成。