如何绘制图形聚类系数的分布

Question

我是 networkx 和 pyplot 的新手，我只是想知道如何绘制局部聚类系数的分布图。绘制度数分布更简单，因为 degree_histogram 函数会为您完成，但我不确定该怎么做。

g = nx.erdos_renyi_graph(1000, 0.02, seed = None, directed = False)
gc = g.subgraph(max(nx.connected_components(g)))
lcc = nx.clustering(gc)

Answer 1

您可以根据聚类为每个节点分配一种颜色。 Matplotlib 的 plt.get_cmap() can indicate a range of colors. And a norm 说明聚类值将如何映射到该颜色范围。可选地，可以添加一个颜色条来显示对应关系。

为了简单地显示分布，可以使用聚类值绘制 histogram。

下面的示例使用稍微调整的参数来创建图表。

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.cm import ScalarMappable
import networkx as nx

g = nx.erdos_renyi_graph(50, 0.1, seed=None, directed=False)
gc = g.subgraph(max(nx.connected_components(g)))
lcc = nx.clustering(gc)

cmap = plt.get_cmap('autumn')
norm = plt.Normalize(0, max(lcc.values()))
node_colors = [cmap(norm(lcc[node])) for node in gc.nodes]

fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(ncols=2, figsize=(12, 4))
nx.draw_spring(gc, node_color=node_colors, with_labels=True, ax=ax1)
fig.colorbar(ScalarMappable(cmap=cmap, norm=norm), label='Clustering', shrink=0.95, ax=ax1)

ax2.hist(lcc.values(), bins=10)
ax2.set_xlabel('Clustering')
ax2.set_ylabel('Frequency')

plt.tight_layout()
plt.show()

如何绘制图形聚类系数的分布

How to plot the distribution of a graphs clustering coefficient

python

cluster-analysis

matplotlib

networkx