使用 PCA 函数返回不同的值

Question

有人可以向我解释一下它们有何不同吗？

#First Type of PCA.  Scales and Transposes manually
pr.data <- prcomp(scale(t(data)))

#Second Type of PCA
pr.data <- prcomp(data, retx=TRUE, scale=TRUE)

难道只是一个转置（第一个）第二个不转置？

Answer 1

我认为 t(data) 肯定会影响你的数据，因为你将 "samples vs. features" 的位置切换到 "features vs. samples." 转置矩阵将 "flip" 分析。

使用 PCA 函数返回不同的值

Different Valuse Returned from Using PCA Function

r

pca