通过多个键和 python 中的 int 和 None 数据对字典进行排序

Question

所以我有一个字典：

marker_dict[experiment_id] = {'SM0012AQ': { 'chromosome' : 1, 'linkageGroup':8, 'positionCm' : 45,'qualityStatus' : 'A' },
 'SM0075AQ': { 'chromosome' : 1, 'linkageGroup': 7, 'positionCm' : ,'qualityStatus' : 'A' }, 
'SM0078BQ': { 'chromosome' : 3, 'linkageGroup': 78, 'positionCm' : 7,'qualityStatus' : 'B' },
'SM0079PQ': { 'chromosome' : 4, 'linkageGroup': , 'positionCm' : 80,'qualityStatus' : 'B' },
'SM0080BQ': { 'chromosome' : , 'linkageGroup': 78, 'positionCm' : 447,'qualityStatus' : 'T' }}

我想根据 'i.chromosome'、'i.linkageGroup' 和 'i.positionCm'

对我的字典进行排序

我在做什么：

marker_list = sorted(marker_dict[experiment_id].values(), key=lambda i: (i.chromosome, i.linkageGroup, i.positionCm))

我得到了：

TypeError: '<' not supported between instances of 'Nonetype' and 'int'

在 python 2 中，他们在做 :

markerList=sorted(markerDic.values(), key=operator.attrgetter('chromosome','linkageGroup','positionCm'))

你能帮帮我吗，我迷路了！

Answer 1

给出

t = {'SM0012AQ': { 'chromosome' : 1, 'linkageGroup':8, 'positionCm' : 45,'qualityStatus' : 'A' },
    'SM0075AQ': { 'chromosome' : 1, 'linkageGroup': 7, 'positionCm' : None ,'qualityStatus' : 'A' },
    'SM0078BQ': { 'chromosome' : 3, 'linkageGroup': 78, 'positionCm' : 7,'qualityStatus' : 'B' },
    'SM0079PQ': { 'chromosome' : 4, 'linkageGroup': None, 'positionCm' : 80,'qualityStatus' : 'B' },
    'SM0080BQ': { 'chromosome' : None, 'linkageGroup': 78, 'positionCm' : 447,'qualityStatus' : 'T' }}

和None是给int的要求，你可以用

来解决

dict(sorted(t.items(), key=lambda i: (i[1]['chromosome'] if i[1]['chromosome'] is not None else -1, i[1]['linkageGroup'] if i[1]['linkageGroup'] is not None else -1 , i[1]['positionCm'] if i[1]['positionCm'] is not None else -1)))

我假设您拥有的数字为 0 或正数。如果你也可以有负数，你需要将 -1 更改为一个非常大的负数。

结果：

{'SM0080BQ': {'chromosome': None,
  'linkageGroup': 78,
  'positionCm': 447,
  'qualityStatus': 'T'},
 'SM0075AQ': {'chromosome': 1,
  'linkageGroup': 7,
  'positionCm': None,
  'qualityStatus': 'A'},
 'SM0012AQ': {'chromosome': 1,
  'linkageGroup': 8,
  'positionCm': 45,
  'qualityStatus': 'A'},
 'SM0078BQ': {'chromosome': 3,
  'linkageGroup': 78,
  'positionCm': 7,
  'qualityStatus': 'B'},
 'SM0079PQ': {'chromosome': 4,
  'linkageGroup': None,
  'positionCm': 80,
  'qualityStatus': 'B'}}

Answer 2

如果所有值都大于零，您可以使用 or 0 的原始方法将 None 值转换为零，然后按排序顺序排在第一位：

sorted(marker_dict[experiment_id].values(), 
       key=lambda i: (i.chromosome or 0, i.linkageGroup or 0, i.positionCm or 0))

否则，您可以编写一个小函数来处理 None 值，方法是将数字转换为元组，该元组在值前加上 True/False 前缀，具体取决于它不是 None。

def None1st(*numbers): return [(n is not None,n or 0) for n in numbers]

sorted(marker_dict[experiment_id].values(), 
       key=lambda i: None1st(i.chromosome, i.linkageGroup, i.positionCm))

通过多个键和 python 中的 int 和 None 数据对字典进行排序

Sort dict by multiple keys and with int and None data in python

python

sorting

lambda

types