如何使用 sed 删除特定字符后的数字？
How can I remove numbers after a specific character with sed?
我需要修改一个 .fasta 文件，如下所示：
>Contig_1;2
AGATC...
>Contig_2;345
AaGGC...
>Contig_3;22
GGAGA...
并将其转换为：
>Contig_1
AGATC...
>Contig_2
AaGGC...
>Contig_3
GGAGA...
我尝试执行以下操作，但没有按预期工作。
sed -i 's/;*\n/\n/g' file.fasta
有人可以给我一些建议吗？谢谢！
你可以使用
sed -i 's/;[^;]*$//' file.fasta
参见 online demo:
s='>Contig_1;2
AGATC...
>Contig_2;345
AaGGC...
>Contig_3;22
GGAGA...'
sed 's/;[^;]*$//' <<< "$s"
输出：
>Contig_1
AGATC...
>Contig_2
AaGGC...
>Contig_3
GGAGA...
请注意 sed 不会将换行符放入模式 space 中（因为您使用的是 GNU sed，您可以使用 [=15= 强制它这样做]，但这里没有必要），并且您不能在 sed 命令中将换行符与 \n 匹配。
;[^;]*$ 模式匹配
; - 一个 semi-colon[^;]* - ; 以外的任何零个或多个字符（如果您需要确保匹配数字，请替换为 [0-9]* 或 [[:digit:]]*）$ - 字符串结尾。
请注意，此处不需要 g 标志，因为此命令需要每行执行一次替换。
第一个解决方案： 你可以用awk让它变得非常简单。用你展示的示例编写，在 GNU awk.
awk -F';' '/^>/{NF=1} 1' Input_file
解释： 简单的解释就是，将所有行的字段分隔符设置为;。在主程序检查条件中，如果行从 > 开始，则将 NF（字段数）设置为 1，这将在第一次出现 ;.
之前保留值
第二个解决方案 你想寻找所有类型的线（无论是否以 > 开头）并且你在第一次出现 ; 之前需要值，然后尝试以下解决方案：
awk -F';' '/;/{NF=1} 1' Input_file
我们可以结合使用cat命令和awk来显示输出。
cat filename | awk -F ';' '{print }'
这里';'将作为文件分隔符，然后屏幕上只会显示第一个字段。
我需要修改一个 .fasta 文件，如下所示：
>Contig_1;2
AGATC...
>Contig_2;345
AaGGC...
>Contig_3;22
GGAGA...
并将其转换为：
>Contig_1
AGATC...
>Contig_2
AaGGC...
>Contig_3
GGAGA...
我尝试执行以下操作，但没有按预期工作。
sed -i 's/;*\n/\n/g' file.fasta
有人可以给我一些建议吗？谢谢！
你可以使用
sed -i 's/;[^;]*$//' file.fasta
参见 online demo:
s='>Contig_1;2
AGATC...
>Contig_2;345
AaGGC...
>Contig_3;22
GGAGA...'
sed 's/;[^;]*$//' <<< "$s"
输出：
>Contig_1
AGATC...
>Contig_2
AaGGC...
>Contig_3
GGAGA...
请注意 sed 不会将换行符放入模式 space 中（因为您使用的是 GNU sed，您可以使用 [=15= 强制它这样做]，但这里没有必要），并且您不能在 sed 命令中将换行符与 \n 匹配。
;[^;]*$ 模式匹配
;- 一个 semi-colon[^;]*-;以外的任何零个或多个字符（如果您需要确保匹配数字，请替换为[0-9]*或[[:digit:]]*）$- 字符串结尾。
请注意，此处不需要 g 标志，因为此命令需要每行执行一次替换。
第一个解决方案： 你可以用awk让它变得非常简单。用你展示的示例编写，在 GNU awk.
awk -F';' '/^>/{NF=1} 1' Input_file
解释： 简单的解释就是，将所有行的字段分隔符设置为;。在主程序检查条件中，如果行从 > 开始，则将 NF（字段数）设置为 1，这将在第一次出现 ;.
第二个解决方案 你想寻找所有类型的线（无论是否以 > 开头）并且你在第一次出现 ; 之前需要值，然后尝试以下解决方案：
awk -F';' '/;/{NF=1} 1' Input_file
我们可以结合使用cat命令和awk来显示输出。
cat filename | awk -F ';' '{print }'
这里';'将作为文件分隔符，然后屏幕上只会显示第一个字段。