Bash: 重命名文件名的开头

Question

我有几个文件，如下所示：

1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_2.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_2.fastq.gz

...即有两个文件以 1_ 开头并以 _1.fastq.gz 或 _2.fastq.gz 结尾，两个文件以 [=19 开头也是如此=].我要做的是cat以_1.fastq.gz结尾的两个文件，像这样：

cat 1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz \ 
    2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz \
    > 150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz

... 以便它们被合并并删除它们的前缀。我在比这更多的文件夹中有更多的文件，所以我想自动化它。我尝试了以下代码，但无济于事：

for f in *_*_1.fastq.gz
do
    cat $f "${f/^1_/2_}" > "${f/^1_/}"
done

我认为我不太了解这种替换方法，但这是我过去用于不太复杂的文件名的方法（当它们只有不同的后缀，没有前缀时）。我认为开头的 ^ 表示文件名的开头，但它似乎不像我想要的那样工作，所以很明显我做错了什么。我尝试进行一些故障排除：

for f in *_*_1.fastq.gz
    do
        echo "${f/^1_/}"
    done

...给我...

1_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz
2_150901_AC7GLHANXX_P2258_101_1.fastq.gz

...这不是我想的那样。有人知道我该怎么做吗？

[编辑，澄清非重复问题]

这个问题和我之前的问题不同的是，我还有一个文件名前缀，而且这个前缀也存在于文件名的中间。另一个问题有一个更简单的情况，其中只有一个后缀需要重命名。

Answer 1

找到“1"s then check for the "2” 如果两者都cat在一起，删除部分。

for f in 1_*_1.fastq.gz
do
      g="2_${f#1_}"
      if [ -f "$g" ]
      then
            cat "$f" "$g" > "${f#1_}" && rm "$f" "$g"
      fi
done

Answer 2

如果我处于你的位置，假设目录中只有这种格式的文件，我会采用这样的过程：

$ ls | cut -b3- | sort -u | tee stems.lst # list the stems
$ while read stem; do cat *_$stem > $stem; done <stems.lst

在你上线之前在测试目录中尝试这个，否则你会弄乱文件名并且恢复起来会很痛苦。

结束语：

技巧：由于重定向，这里有点不方便，但是通过运行某种形式的 echo "cat *_$stem > $stem" 在用真实的东西替换它之前。
之后别忘了删除 stem.lst
如果它稳定并且您需要重复，您可以将词干列表直接从 sort -u 传输到 while
（如果这个问题对处于相同情况的其他人有用）如果你的文件名包含任何奇怪的东西，请在 while 行

$stem

Bash: 重命名文件名的开头

Bash: rename beginning of filename

bash

filenames

rename