R 数据汇总 table

Question

您将如何显示相当短的 (~40) 行数据的简短压缩版本 table？我知道对于非常长的数据 tables 它会自动显示这个显示第一行和最后 5 行的缩短版本。然而，对于短数据 tables，它只会显示整个数据 table。有什么办法可以强制短版吗？

缩略版示例：

         tpl       motif                 refName strand base score ipdRatio coverage
  1:    7098 ATCAAGGTCCT scf7180000000004|quiver      0    A    64    6.347       38
  2:   46246 ATCAATCGCCT scf7180000000004|quiver      0    A   213    6.371      148
  3:   57947 ATCATATTCCT scf7180000000004|quiver      0    A   226    6.464      147
  4:   59260 ATCAATTACCT scf7180000000004|quiver      0    A   203    5.715      120
  5:   72361 ATCATGTTCCT scf7180000000004|quiver      0    A   205    6.449      144
 ---                                                                                
537: 2835276 ATCATTTGCCT scf7180000000004|quiver      1    A   201    6.329      153
538: 2837973 ATCAATTGCCT scf7180000000004|quiver      1    A   215    5.982      146
539: 2842508 ATCAAATACCT scf7180000000004|quiver      1    A   196    4.241      157
540: 2844725 ATCGTACTCCT scf7180000000004|quiver      1    A   227    6.123      140
541: 2847076 ATCAGTACCCT scf7180000000004|quiver      1    A   158    5.990      120

Answer 1

如果您希望为 10 行或更多行的数据表显示 "summarized" 版本，请尝试 options(datatable.print.nrows=10)

该选项的默认值为 50。在 Data Table FAQ 2.11

中了解更多信息

R 数据汇总 table

R summary of data table

r

data.table