install.packages knitr 文档失败："trying to use CRAN without setting a mirror"

Question

使用下面的代码我得到了我想要的数据，但由于某种原因我无法弄清楚 knitr 不允许我编译 PDF 文档，如下所示：

我的代码：

install.packages("weatherData")
library(weatherData)
istanbul <- getWeatherForDate("Istanbul",
                              start_date = Sys.Date() - 41, 
                              end_date = Sys.Date())

没有问题，但我在尝试编译 PDF 时收到以下消息：

Quitting from lines 3-31 (ist_weather.spin.Rmd) 
Error in contrib.url(repos, type) : 
  trying to use CRAN without setting a mirror
Calls: <Anonymous> ... eval -> eval -> install.packages -> grep -> contrib.url
Execution halted

Answer 1

Knitr 生成一个 R 会话，没有默认的 cran 镜像，除非你特别要求一个。当我们使用 Rstudio 时，我们往往会忘记我们需要为每个 R 会话设置 CRAN，因为它会处理它，但仅用于交互使用，而不用于 knitr。

您可以尝试将镜像指定为 install.packages 参数：

install.packages("weatherData",repos = "http://cran.us.r-project.org")

或者，您可以在 .Rprofile 中设置默认的 CRAN 镜像。参见 this answer。

也就是说，通过 knitr 文档安装软件包不是一个好主意，您可能会编译多次。你应该假设人们知道如何在需要时安装丢失的包，或者至少在再次安装之前测试是否安装了包

if(!require(weatherData)) install.packages("weatherData",repos = "http://cran.us.r-project.org")

Answer 2

您必须在 R 中设置 CRAN 存储库。为此，请启动 R 或 RStudio。在 R 终端运行以下代码。

r = getOption("repos")
r["CRAN"] = "http://cran.us.r-project.org"
options(repos = r)
install.packages("weatherData")

以上代码在R中定义了CRAN仓库，下次安装包时无需再定义。

另一种方法是运行 install.packages("weatherData", repos="http://cran.us.r-project.org")。但是，对于第二种解决方案，存储库未设置，您必须在每个包安装中将其作为参数传递。

Answer 3

老实说，

它对我不起作用，因为我安装了软件包，这些代码行中断了编织功能。当我删除所有包含安装包的行（并使用可用的最新 R 和 R Markdown）时，此错误消失了。

install.packages knitr 文档失败："trying to use CRAN without setting a mirror"

install.packages fails in knitr document: "trying to use CRAN without setting a mirror"

r

knitr