R：更改 heatmap.2 rowname 列的大小

Question

我使用了以下代码：

library("gplots")
heatmap.2(assay(vsd)[ens_union,], trace = "none", density.info = "none")

生成以下热图：

如您所见，行标签已被截断（例如，第一个应该是 ENSMUSG00000000088，但只显示 ENSMUSG0）。我怎样才能重新调整图的大小以包括整个标签？

Answer 1

只需添加 margins 参数

library("gplots")

# generate some example data
data <- as.matrix(mtcars)

# make ridiculously long names
long.names     <- paste("ENSMUSG000000000", rownames(mtcars))
rownames(data) <- long.names

# GO!
heatmap.2(data, trace = "none", density.info = "none", 
          margins = c(8, 16))

别忘了您还可以根据需要更改字体大小 cexRow

R：更改 heatmap.2 rowname 列的大小

R: Changing the size of a heatmap.2 rowname column

r

heatmap

gplots