pyspark 负载分布不均,零件尺寸增加一倍
pyspark distributes load unevenly with parts increasing in double size
我的 pyspark 进程的输出部分大小不均匀,但可以预见具有 n**2 模式(0、1、2、4、8、16 等)。这是我的过程:
我像这样从 Google BigQuery 加载数据:
dConf = {
"mapred.bq.project.id": project_id,
"mapred.bq.gcs.bucket": bucket,
"mapred.bq.input.project.id": project_id,
"mapred.bq.input.dataset.id":dataset_id,
"mapred.bq.input.table.id": table_id
}
rdd_dataset_raw = sc.newAPIHadoopRDD(
"com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.JsonTextBigQueryInputFormat",
"org.apache.hadoop.io.LongWritable",
"com.google.gson.JsonObject",
conf=dConf
)
其输出如下所示 (rdd_dataset_raw.take(2)
):
[(0, u'{"group_id":"1","pertubations":"Current Affairs,Sport,Technology"}'),
(67, u'{"group_id":"2","pertubations":"Current Affairs,Sport,Celeb Gossip"}')]
一些琐碎的处理,重新分区:
rdd_dataset = (
rdd_dataset_raw
.repartition(nr_partitions)
.map(lambda t, json=json: json.loads(t[1]))
)
看起来像这样:
[{u'group_id': u'1', u'pertubations': u'Current Affairs,Sport,Technology'},
{u'group_id': u'2', u'pertubations': u'Current Affairs,Sport,Celeb Gossip'}]
当我将 RDD 保存到 Google 存储时:
rdd_dataset_raw.saveAsTextFile("gs://bucket/directory")
这将创建 nr_partitions
个零件文件。
但是,这些零件文件的大小并不均匀。它们以 n**2
的形式增加,其中 n 是零件文件编号。换句话说,
part-00000
包含 0 行
part-00001
包含 1 行
part-00002
包含 2 行
part-00003
包含 4 行
part-00004
包含 8 行
等等
其中大部分也几乎立即完成,其中后面的部分 运行 内存不足。
这是怎么回事!?如何使分区负载均匀?
就像用 partitionBy
替换 repartition
一样简单:
rdd_dataset = (
rdd_dataset_raw
.partitionBy(nr_partitions)
.map(lambda t, json=json: json.loads(t[1]))
)
请注意,这需要尽早完成。传递一个未分区的 rdd 然后分区后来坏了。
我的 pyspark 进程的输出部分大小不均匀,但可以预见具有 n**2 模式(0、1、2、4、8、16 等)。这是我的过程:
我像这样从 Google BigQuery 加载数据:
dConf = {
"mapred.bq.project.id": project_id,
"mapred.bq.gcs.bucket": bucket,
"mapred.bq.input.project.id": project_id,
"mapred.bq.input.dataset.id":dataset_id,
"mapred.bq.input.table.id": table_id
}
rdd_dataset_raw = sc.newAPIHadoopRDD(
"com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.JsonTextBigQueryInputFormat",
"org.apache.hadoop.io.LongWritable",
"com.google.gson.JsonObject",
conf=dConf
)
其输出如下所示 (rdd_dataset_raw.take(2)
):
[(0, u'{"group_id":"1","pertubations":"Current Affairs,Sport,Technology"}'),
(67, u'{"group_id":"2","pertubations":"Current Affairs,Sport,Celeb Gossip"}')]
一些琐碎的处理,重新分区:
rdd_dataset = (
rdd_dataset_raw
.repartition(nr_partitions)
.map(lambda t, json=json: json.loads(t[1]))
)
看起来像这样:
[{u'group_id': u'1', u'pertubations': u'Current Affairs,Sport,Technology'},
{u'group_id': u'2', u'pertubations': u'Current Affairs,Sport,Celeb Gossip'}]
当我将 RDD 保存到 Google 存储时:
rdd_dataset_raw.saveAsTextFile("gs://bucket/directory")
这将创建 nr_partitions
个零件文件。
但是,这些零件文件的大小并不均匀。它们以 n**2
的形式增加,其中 n 是零件文件编号。换句话说,
part-00000
包含 0 行
part-00001
包含 1 行
part-00002
包含 2 行
part-00003
包含 4 行
part-00004
包含 8 行
等等
其中大部分也几乎立即完成,其中后面的部分 运行 内存不足。
这是怎么回事!?如何使分区负载均匀?
就像用 partitionBy
替换 repartition
一样简单:
rdd_dataset = (
rdd_dataset_raw
.partitionBy(nr_partitions)
.map(lambda t, json=json: json.loads(t[1]))
)
请注意,这需要尽早完成。传递一个未分区的 rdd 然后分区后来坏了。