对 Entrez.esearch 和 Entrez.efetch 应用语言过滤器

Question

我正在使用 Biopython 查询 PubMed 的一些结果。这是代码的一部分：

def search(query):
        Entrez.email = 'gandalf@rivendell.lotr'
        handle = Entrez.esearch(db   = 'pubmed',
                                sort = 'relevance',
                                retmax = '30000',
                                retmode = 'xml',
                                term = query)
        results = Entrez.read(handle)
        return results

我希望结果只有英文论文。我检查了 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25499/ 的文档，但没有找到此过滤器的属性。

PubMed 的手动搜索允许按语言过滤。我该如何修改代码？

Answer 1

您可以修改搜索词如下所示：

query = "{} AND English[Language]".format(query)

handle = Entrez.esearch(db='pubmed',
                        sort='relevance',
                        retmax='30',
                        retmode='xml',
                        term=query)

对 Entrez.esearch 和 Entrez.efetch 应用语言过滤器

Applying language filter to Entrez.esearch and Entrez.efetch

python

filter

biopython

pubmed